22.02.2023 | Leave a comment Содержание broken перевод и транскрипция, произношение, фразы и предложенияприлагательноеФразыПредложенияперевод на русский, синонимы, антонимы, произношение, примеры предложений, транскрипция, значение, словосочетания Транскрипция и разбитое сердце Варианты доступа Ссылки Информация об авторе Авторы и организации Права и разрешения Об этой статье Эта статья цитируется Моделирование роста и ремоделирования сердечной ткани Broken TALEs: Эффекторы, подобные активаторам транскрипции, заселяют частично свернутые состояния Принадлежности Авторы Принадлежности Абстрактный Цифры Похожие статьи Цитируется broken перевод и транскрипция, произношение, фразы и предложения [ˈbrəʊkən]прилагательное разбитый ломаный прерывистыйСинонимы: dogleg, intermissive, intermittent, beat-up, whacked, irregular, faltering, interrupted.Фразыbroken glassразбитое стеклоПредложенияIn the digital era, broken clocks are not right twice a day. They’re just rubbish.В наш цифровой век сломанные часы уже не показывают правильное время дважды в сутки. Они просто мусор.You don’t have to speak perfect English. Broken English is OK as long as you can make yourself understood.Ты не обязан говорить по-английски хорошо. Ломаный английский — это нормально, пока ты можешь быть понятным другим.The spell was broken and the pig turned into a man.Заклятье было разрушено, и свинья обернулась человеком.Glass has the ability to be broken under pressure.У стекла есть свойство ломаться под действием давления.Tom and Mary have broken up.Том и Мэри расстались.My radio has broken down again.Моё радио опять вышло из строя.I think I’ve broken my arm.По-моему, я руку сломал.I think that machine doesn’t need any more broken parts. I can’t achieve anything with my bare hands.Думаю, машина и так достаточно поломана. Я не могу ничего сделать голыми руками.Have I broken a law, officer?Разве я нарушил закон, офицер?My father fixed the broken chair.Мой отец починил сломанный стул.Tom pointed to the broken headlight.Фома сделал жест рукой в сторону поломанной фары.Have you ever broken a bone?Ты себе когда-нибудь что-нибудь ломала?She has broken with him. Она порвала с ним.Can you fix the broken radio?Ты можешь починить сломанный радиоприёмник?He denies having broken the window.Он отрицает, что разбил окно.On the doorstep sat his old woman, with the broken wash-tub before her.На пороге сидит его старуха, а пред нею разбитое корыто.He had his arm broken during the game.Он сломал себе руку во время игры.Tom visited Mary, who was in the hospital with a broken bone.Том навестил Мэри, которая лежала в больнице с переломом.The broken window was boarded up.Разбитое окно было заделано досками.Tom cut his finger on the broken glass.Том порезал палец о разбитое стекло.I’ve never broken the law.Я никогда не нарушал закон.I know from experience; playing soccer barefoot is a bad idea. You could easily end up with broken toes.Я по опыту знаю, что играть в футбол босиком — плохая идея. Можно запросто сломать пальцы на ногах.Tom confessed that he had broken the window.Том признался в том, что он разбил окно.My father fixes broken chairs.Мой отец ремонтирует поломанные стулья.The truce was broken by gunfire in the Ukraine.Перемирие нарушилось из-за стрельбы на Украине.Tell Tom I’ve a broken leg.Скажите Тому, что у меня сломана нога.The rules have broken themselves.Правила сами нарушились.It must have been broken during shipping.Это, должно быть, сломалось во время транспортировки.Tom hasn’t broken any laws.Том не нарушал никаких законов.I repair broken phones.Я занимаюсь починкой неисправных телефонных аппаратов.перевод на русский, синонимы, антонимы, произношение, примеры предложений, транскрипция, значение, словосочетания A broken leg or a shattered jaw would mean a slow and painful death. Сломанная нога или челюсть приведут к медленной и мучительной смерти. She brought a broken leg and several cracked ribs into my care as well. Она добавила к моим заботам сломанную ногу и несколько треснувших ребер. He’d be destroyed, like a horse with a broken leg. Уничтожили, как лошадь со сломанной ногой. The passenger’s broken leg was not treated until after he had left Israel. Этот пассажир получил медицинскую помощь в связи с его сломанной ногой только после его выезда из Израиля. There’s a guy named Jack Young blood — played the super bowl with a broken leg! Есть такой парень по имени Джек Янгблад… так вот он играл на супер — кубке со сломанной ногой! For example, almost everyone agrees that a broken leg or pneumonia are bad things to have. Так, например, все согласятся с тем, что очень плохо сломать ногу или заболеть воспалением легких. So he walked on air and sprained an ankle-close enough to a broken leg and Alvarez was there when it happened. Словом, Смотритель прошелся по воздуху и вывихнул колено, что довольно близко к перелому, причем Альварес при сем присутствовал. I’ll take my rig out to the woods, tell the rangers I’m a lost hiker with a broken leg. Я отойду подальше в лес, скажу рейнджерам, что я заблудившийся турист и сломал ногу. And the wife, with a broken leg and locked up in the house. И жена — со сломанной ногой, запертая дома. A couple of licks will cure most any sickness short of a broken leg- Стеганите его разок — другой, и любая хворь мигом пройдет, кроме, может, сломанной ноги. .. I stuffed a hand towel and a roll of adhesive into my pockets… so I could fake something that looked like a cast on a broken leg. Я захватил с собой полотенце и скотч,.. …чтобы потом изобразить подобие гипса на ноге. Guy in the back has a broken leg. У парня сзади сломана нога. A horse’s broken leg will never heal. У лошадей сломанные ноги не исцеляются. He’d be destroyed, like a horse with a broken leg. Уничтожили, как лошадь со сломанной ногой. And add to that the broken leg. И добавь к этому сломанную ногу. This letter, sealed with a small seal in blue wax, begged Monsieur Bovary to come immediately to the farm of the Bertaux to set a broken leg. Письмо, запечатанное маленькой, синего сургуча, печатью, содержало мольбу к г — ну Бовари как можно скорее прибыть на ферму Берто и оказать помощь человеку, сломавшему себе ногу. He’d had a significant injury in the past. A broken leg, a nasty one. У него была серьёзная травма ноги, неприятный открытый перелом. It was sick, malnourished… with a broken leg, but now… my trusty assistant… Она была больной, истощенной, со сломанной лапкой, но теперь моя верная помощница… But I inevitably went onto my broken leg. Но неизбежно нагружал и сломанную . He had festering wounds, a broken leg, and deep cuts on his back that exposed his bare ribs. У него были гноящиеся раны, сломанная нога и глубокие порезы на спине, обнажавшие голые ребра. Though they reach the summit, a powerful storm develops and Simpson suffers a badly broken leg in a fall during the descent. Несмотря на то, что они достигают вершины, развивается мощный шторм, и Симпсон страдает от сильного перелома ноги при падении во время спуска. He then spends days crawling back to base camp across glaciers and rocks, despite his broken leg, frostbite, and severe dehydration. Затем он целыми днями ползет обратно в базовый лагерь по ледникам и скалам, несмотря на сломанную ногу, обморожение и сильное обезвоживание. It was impossible for him to climb up to the entrance of the crevasse, because of the overhanging ice and his broken leg. Из — за нависшего льда и сломанной ноги он не мог подняться ко входу в расщелину. The civilians reported her most serious injury appeared to be a broken leg. Гражданские сообщили, что наиболее серьезной травмой у нее оказался перелом ноги. Tristran makes Yvaine a simple crutch to help her walk as her broken leg hinders her movement. Тристран делает Ивейн простой костыль, чтобы помочь ей идти, так как сломанная нога мешает ей двигаться. He suffered a broken leg, fractured skull and an injury to an eye. Он получил перелом ноги, перелом черепа и ушиб глаза. He missed the entire 1990–91 season recovering from broken leg suffered in an auto accident during training in the summer of 1990. Он пропустил весь сезон 1990 — 1991 годов, восстанавливаясь после перелома ноги, полученного в автомобильной аварии во время тренировки летом 1990 года. While recovering from a broken leg, Albini began playing bass guitar and participated in bass lessons in high school for one week. Выздоравливая после перелома ноги, Альбини начал играть на бас — гитаре и в течение одной недели участвовал в уроках баса в средней школе. He alleged that the abuse resulted in a broken leg and arm. Он утверждал, что жестокое обращение привело к перелому ноги и руки. Lewis finished the book while mending a broken leg on Jackfish Island in Rainy Lake, Minnesota. Льюис закончил книгу, пока чинил сломанную ногу на острове джекфиш в Рейни — Лейк, штат Миннесота. Jannicke treats Morten’s broken leg with alcohol and the superglue. Дженник лечит сломанную ногу Мортена спиртом и суперклеем. Arthur, despite his broken leg, insists on accompanying them to find his wife. Артур, несмотря на сломанную ногу, настаивает на том, чтобы сопровождать их, чтобы найти свою жену. Shortly after the appearance Schmidt suffered a broken leg which led to cancellation of the band’s UK tour. Вскоре после своего появления Шмидт получил перелом ноги, что привело к отмене британского турне группы. While the evacuation was considered a success, one volunteer suffered a broken leg, while the remaining 32 received slide burns. Хотя эвакуация была признана успешной, один доброволец получил перелом ноги,а остальные 32 получили ожоги от скольжения. His leg is broken, and there was arterial damage we had to repair. У него сломана правая нога и есть небольшое артериальное повреждение, которое мы обязательно исправим. His right leg was broken and lay at an unnatural angle. Правая нога тоже была сломана и лежала под неестественным углом. MacShaughnassy having had his innings, Jephson took a turn, and told us a pathetic story about an unfortunate mongrel that was run over in the Strand one day and its leg broken. После Мак — Шонесси пришла очередь Джефсона, и он рассказал нам волнующую историю про жалкую дворняжку, которую переехала карета на Стрэнде. Pretend that you never learned to dance or have broken your leg. Выдумать, что не училась танцевать или сломала ногу. Not so fortunate had he been in his ill-considered leap, for he had broken his right leg at the hip joint. Прыжок его оказался весьма неудачным, и он сломал свою правую ногу у бедренного сустава. Blood gushed out of his sleeve and mouth. He collapsed onto his sound right arm, dragging his broken left leg. Кровь у того текла из рукава, текла изо рта, и он, припадая на правую здоровую руку, тянул переломленную левую ногу. When your leg is broken, or your spine, your skull fractured when you can’t look after yourself any more. Когда у тебя сломана нога, или спина, или проломлен череп когда ты больше не можешь сам о себе позаботиться. The last thing I saw was the sight of Brother’s left leg being broken down and disappearing. Последнее, что я помню, — левая нога брата, которая распадалась и исчезала на глазах. One broken hind-leg, he went on. Three broken ribs, one at least of which has pierced the lungs. Перелом задней ноги, — продолжал тот. — Три сломанных ребра и по крайней мере одно из них прошло в легкое. Must’ve broken when it snapped on Carl’s leg. Возможно сломался , когда защёлкнулся на ноге Карла. Her leg had been broken in five places. Её нога была сломана в пяти местах. It might be that Coupeau had broken a leg, or fallen under a wagon and been crushed and that might be good riddance to bad rubbish. А впрочем, если даже Купо и попал под колеса или сломал себе шею, ей нисколько его не жалко! Grandpa, her arm is broken just like my leg, don’t we make a perfect match? Дедуля, её ручка сломана , как и моя ножка. Мы так сочетаемся. The most cursory examination revealed it. His right arm, leg, and back were broken; his limbs were paralyzed from the hips; and the likelihood of internal injuries was large. Это стало ясно даже при беглом осмотре: перелом правой руки, бедра и позвоночника; ноги парализованы; вероятно, повреждены и внутренние органы. The major’s leg is broken in two places. У майора сломана нога в двух местах. With his leg broken as a result of the bus accident, Ollie ends up in hospital and is visited by Trudy, Grant and Stan. С переломом ноги в результате аварии автобуса Олли попадает в больницу, где его навещают Труди, Грант и Стэн. He spent over $2,000 to care for the bird, including a device he built to support her comfortably while her broken wing and leg healed. Он потратил более 2000 долларов на уход за птицей, включая устройство, которое он построил, чтобы удобно поддерживать ее, пока ее сломанное крыло и нога зажили. One of the two, John Sheppard, falls into a broken pipe and gets his leg trapped, just as a rainstorm causes the pipe to begin filling with water. Один из них, Джон Шеппард, падает в сломанную трубу и попадает в ловушку своей ноги, как раз когда ливень заставляет трубу наполняться водой. The broken toes were held tightly against the sole of the foot while the foot was then drawn down straight with the leg and the arch of the foot was forcibly broken. Сломанные пальцы крепко прижимались к подошве стопы, а затем ступня опускалась вниз вместе с ногой, и свод стопы был насильственно сломан . The coroner’s office found that Myers died of a PE that had broken off from a deep vein thrombosis in the leg. Коронерская служба установила, что Майерс умер от инфаркта миокарда, который развился из — за тромбоза глубоких вен на ноге. Orville was badly injured, suffering a broken left leg and four broken ribs. Орвилл был тяжело ранен, у него была сломана левая нога и четыре ребра. He suffered a broken right leg, broken ribs and head and facial injuries. Он получил перелом правой ноги, сломанные ребра, а также травмы головы и лица. Mauri had broken his leg in a skiing accident ten years earlier and his tibia never properly healed. Подключаемые гибридные или электрические автомобили могут быть использованы для их возможностей хранения энергии. Konstantin soon joined them, although he had fallen from a horse and broken his leg. Константин вскоре присоединился к ним, хотя и упал с лошади и сломал ногу. The school district’s superintendent comes to Walnut Grove, looking for someone who can replace a teacher who has fallen and broken her leg. Начальник школьного округа приезжает в ореховую рощу в поисках кого — нибудь, кто мог бы заменить учительницу, упавшую и сломавшую ногу. Lockhart realizes that his leg is not broken and he is being kept prisoner. Локхарт понимает, что его нога не сломана и он находится в плену. Транскрипция и разбитое сердце Опубликовано: 12 марта 1998 г. Развитие сердца Гарри П. Нолан 1 Природа том 392 , страницы 129–130 (1998 г.)Процитировать эту статью 587 доступов 13 цитирований Сведения о показателях Врожденные пороки сердца встречаются у поразительного 1% живорожденных 1 , 2 , а пороки сердца плода связаны со многими беременностями, которые заканчиваются мертворождением или самопроизвольным абортом 2 . Почему из всех сложных систем органов сердце так подвержено порокам развития во время внутриутробного развития? Генетические факторы, вероятно, играют центральную роль во многих врожденных пороках сердца, но осложняющие факторы, такие как токсины окружающей среды или диета и возраст родителей, вероятно, влияют на тяжесть этих нарушений. Несмотря на неопровержимые статистические данные об их распространенности и перед лицом захватывающего генетического прогресса 3 , 4 , вовлекающего несколько генов в программу развития нормального сердца, мы все еще не понимаем биохимически, почему пороки сердца так распространены. Это в основном связано с отсутствием молекулярных мишеней, которые могли бы указывать на превентивные терапевтические подходы или намечать сигнальные системы для дальнейшего изучения. Это предварительный просмотр содержимого подписки, доступ через ваше учреждение Варианты доступа Подписаться на журнал Получить полный доступ к журналу на 1 год 199,00 € всего 3,90 € за выпуск Подписаться Расчет налогов будет завершен во время оформления заказа. Купить статью Получите ограниченный по времени или полный доступ к статье на ReadCube. 32,00 $ Купить Все цены указаны без учета стоимости. Рисунок 1: Клапаны сердца, которые зависят от активности NF-ATc плода. Рисунок 2: Общие пути активации NF-ATc в Т-клетках и эндокардиальных клетках плода? a , активация Т-клеток. Ссылки Ferencz, C. et al. Ам. Дж. Эпидемиол . 121 , 31–36 (1985). Google ученый Hoffman, J. I. E. Pediatr. Кардиол . 16 , 155–165 (1995). Google ученый Россант, Дж. Тираж Рез. . 78 , 349–353 (1996). Google ученый Олсен, Е. Н. и Сривастава, Д. Science 272 , 671–676 (1996). Google ученый де ла Помпа, Дж. и др. Природа 392 , 182–186 (1998). Артикул ОБЪЯВЛЕНИЯ КАС Google ученый Рейнджер, А. М. и др. Природа 392 , 186–190 (1998). Артикул ОБЪЯВЛЕНИЯ КАС Google ученый Рао А., Луо К. и Хоган П. Г. Annu. Ред. Иммунол . 15 , 707–747 (1997). Google ученый Nolan, GP Cell 77 , 795–798 (1994). Google ученый Ксантоудакис, С. и др. Наука 272 , 892–895 (1996). Google ученый Ссылки на скачивание Информация об авторе Авторы и организации Кафедра молекулярной фармакологии и кафедра микробиологии и иммунологии Медицинской школы Стэнфордского университета, Стэнфорд, 94305, Калифорния, США Гарри П. Нолан9 Авторы P. Nolan Посмотреть публикации автора Вы также можете искать этого автора в PubMed Google Scholar Права и разрешения Перепечатка и разрешения Об этой статье Эта статья цитируется Моделирование роста и ремоделирования сердечной ткани Вики Ю. Ван Джагир Р. Хуссан Мартин П. Нэш Журнал эластичности (2017) Broken TALEs: Эффекторы, подобные активаторам транскрипции, заселяют частично свернутые состояния . 2016 6 декабря; 111 (11): 2395-2403. doi: 10.1016/j.bpj.2016.10.013. Кэтрин Гейгер-Шуллер 1 , Дуг Баррик 2 Принадлежности 1 Программа молекулярной биофизики, Университет Джона Хопкинса, Балтимор, Мэриленд; Т.К. Дженкинса, факультет биофизики, Университет Джона Хопкинса, Балтимор, Мэриленд. 2 Т.С. Дженкинса, факультет биофизики, Университет Джона Хопкинса, Балтимор, Мэриленд. Электронный адрес: [email protected]. PMID: 27926841 PMCID: PMC5153609 DOI: 10.1016/j.bpj.2016.10.013 Бесплатная статья ЧВК Кэтрин Гейгер-Шуллер и соавт. Биофиз Дж. 2016 . Бесплатная статья ЧВК . 2016 6 декабря; 111 (11): 2395-2403. doi: 10.1016/j.bpj.2016.10.013. Авторы Кэтрин Гейгер-Шуллер 1 , Дуг Баррик 2 Принадлежности 1 Программа молекулярной биофизики, Университет Джона Хопкинса, Балтимор, Мэриленд; Т.К. Дженкинса, факультет биофизики, Университет Джона Хопкинса, Балтимор, Мэриленд. 2 Т.С. Дженкинса, факультет биофизики, Университет Джона Хопкинса, Балтимор, Мэриленд. Электронный адрес: [email protected]. PMID: 27926841 PMCID: PMC5153609 DOI: 10. 1016/j.bpj.2016.10.013 Абстрактный Эффекторные белки, подобные активаторам транскрипции (TALE), содержат большое количество повторов, которые связывают двухцепочечную ДНК, оборачиваясь вокруг ДНК, образуя непрерывную суперспираль. Поскольку несвязанные TALE сохраняют суперспиральную структуру, кажется вероятным, что связывание ДНК требует значительного структурного искажения или частичного развертывания. В этом исследовании мы используем анализ ближайшего соседа «Изинг» консенсусного развертывания повторов TALE (cTALE) для количественной оценки внутренних свободных энергий сворачивания, энергий связи между повторами и распределения свободной энергии частично развернутых состояний, а также для определения того, как эти энергии зависят на последовательности, определяющей ДНК-специфичность (называемой «RVD»). Мы находим умеренный уровень кооперативности как для HD, так и для NS последовательностей RVD (стабилизирующие интерфейсы в сочетании с нестабильными повторами), как это наблюдалось в других белках с линейными повторами. Неожиданно идентичность последовательности RVD влияет как на общую стабильность, так и на баланс внутренней стабильности повторов и энергии межфазного связывания. Используя параметры анализа Изинга, мы проанализировали распределение состояний частичной укладки в зависимости от длины cTALE и последовательности RVD. Мы находим частично развернутые состояния, в которых один или несколько повторов разворачиваются, чтобы быть энергетически доступными. Смешивание повторов с разными последовательностями RVD увеличивает популяцию частично свернутых состояний. Локальное плато свободных энергий сворачивания для центральных повторов, что позволяет предположить, что TALE получают доступ к частично свернутым состояниям, когда один внутренний повтор разворачивается, а соседние повторы остаются свернутыми. Этот разрыв должен позволить TALE получить доступ к суперспирально-разорванным состояниям и может облегчить связывание ДНК. Copyright © 2016 Биофизическое общество. Опубликовано Elsevier Inc. Все права защищены. Цифры Рисунок 1 Сохранение последовательности и структура… Рисунок 1 Сохранение последовательности и структура повторов TALE. ( A ) Логотип последовательности… фигура 1 Сохранение последовательности и структура повторов TALE. ( A ) Логотип последовательности TALE повторяется, показывая сохранение в каждой из 34 позиций. Приведенная ниже последовательность является согласованной последовательностью, используемой в этих исследованиях. В положениях RVD (12, 13) были выбраны два общих мотива узнавания (NS и HD). ( B ) Кристаллическая структура dHax3 с указанием местоположения RVD ( красных палочек ) (18). ( С ) N-концевой кэп ( оранжевый ) представляет собой консервативное расширение повторяющегося домена, состоящее из четырех TALE-подобных повторов (31). ( D ) С-концевой кэп был разработан путем замены гидрофобных остатков, подвергающихся воздействию растворителя, на полярные или заряженные остатки ( розовых сфер ). Чтобы увидеть эту фигуру в цвете, зайдите в интернет. Рисунок 2 Двойной и одинарный консенсус TALE… Рисунок 2 Консенсусные конструкции TALE с двойным и одинарным кэпированием имеют форму α -спирали. Спектры КД в дальнем УФ диапазоне… фигура 2 Консенсусные конструкции с двойным и одинарным кэпированием TALE имеют форму α -спирали. КД-спектры в дальнем УФ-диапазоне повторяющихся конструкций TALE NS с N-кэпом, С-кэпом и обоими кэпами. Спектры соответствуют складчатым, α -спиральным структурам. Условия: 300 мМ NaCl, 10 мМ Трис-HCl (pH 7,4), 5% глицерин, 25°C. Чтобы увидеть эту фигуру в цвете, зайдите в интернет. Рисунок 3 Консенсус Стабильность СКАЗКИ зависит… Рисунок 3 Консенсус Стабильность TALE зависит от последовательности RVD. Индуцированные мочевиной разворачивающиеся переходы TALE… Рисунок 3 Консенсус Стабильность TALE зависит от последовательности RVD. Переходы разворачивания конструкций TALE, индуцированные мочевиной, демонстрируют кооперативные переходы развертывания с двумя состояниями. Индуцированные мочевиной переходы разворачивания каждой конструкции были приспособлены к модели развертывания с двумя состояниями (9). 0085 сплошные линии ). Глобальная стабильность, основанная на средних точках развертывания, значительно варьируется в зависимости от последовательности RVD, хотя наклоны переходов не меняются. Условия: 300 мМ NaCl, 10 мМ Трис-HCl (pH 7,4), 5% глицерин, 25°C. Чтобы увидеть эту фигуру в цвете, зайдите в интернет. Рисунок 4 Зависимость от длины и ограничения TALE… Рисунок 4 Стабильность TALE HD и NS-RVD зависит от длины и ограничения. Индуцированные мочевиной разворачивающиеся переходы… Рисунок 4 Стабильность TALE HD и NS-RVD зависит от длины и ограничения. Индуцированные мочевиной переходы разворачивания конструкций TALE были глобально аппроксимированы с использованием гетерогенной модели ближайшего соседа Изинга (N-концы, пунктирных линий ; C-концы, сплошных линий ; двойные колпачки, пунктирных линий 9). 0018). ( A ) Повторные конструкции NS-типа с увеличивающимся числом повторов для конструкций с N-кэпами и двойными кэпами. Стабильность увеличивается с количеством показанных повторов. ( B ) Показаны конструкции с шестью повторами NS-типа с различной идентичностью кэпирования. N(NS) 6 C наиболее стабилен, за ним следует N(NS) 6 . (NS) 6 C имеет наименьший C м , но самый большой уклон. ( C ) Показаны повторяющиеся конструкции HD-типа с увеличивающимся числом повторов. Увеличение средней точки перехода между (HD) 6 C и (HD) 7 C меньше увеличения в средней точке между N(NS) 5 C и N(NS) 6 C ( A ). ( D ) Показаны конструкции с шестью повторами HD-типа с различной идентичностью кэпирования. Как и в случае повторов NS-типа ( B ), конструкция с двумя кэпами более стабильна, чем конструкция с одинарными кэпами. Условия: 300 мМ NaCl, 10 мМ Трис-HCl (pH 7,4), 5% глицерин, 25°C. Чтобы увидеть эту фигуру в цвете, зайдите в интернет. Рисунок 5 Распространение местных складных бесплатных… Рисунок 5 Распределение свободных энергий локального сворачивания для повторяющихся массивов TALE как функция… Рисунок 5 Распределение свободных энергий локального сворачивания для массивов повторов TALE в зависимости от длины. В каждой позиции вероятности свернутого (и развернутого) повтора рассчитывались из статистической суммы ближайшего соседа с использованием свободных энергий из аппроксимации Изинга. Локальные свободные энергии сворачивания (ΔGlocal°) были рассчитаны по уравнению 4. Для гомополимерных массивов СКАЗ ( A , повторы NS-типа в красном , B , повторы HD-типа в синем ), значения ΔGlocal° центральных повторов уменьшаются с числом повторов до тех пор, пока не будет достигнуто плато в свободной энергии локальной складки ( пунктирные линии ). Это плато в ΔGlocal° ниже (т.е. выше стабильность) для повторов NS ( A ), чем повторов HD ( B ). Конструкции, содержащие как NS-, так и HD-типы повторов, имеют гетерогенное распределение стабильности с локальным развертыванием С-концевых NS-повторов (9).0085 С ). Смешивание повторов NS ( красный ) и HD ( синий ) попеременно уменьшает ΔGlocal° повторов HD, но увеличивает ΔGlocal° повторов NS. Все конструкции показывают изнашивание концевых повторов, как и следовало ожидать от кооперативной модели ближайшего соседа. Чтобы увидеть эту фигуру в цвете, зайдите в интернет. Рисунок 6 Различия в энергетическом разделении для… Рисунок 6 Различия в энергетическом разделении для NS- и HD-RVD приводят к зависимости от длины… Рисунок 6 Различия в энергетическом разделении для NS- и HD-RVD приводят к переключению стабильности, зависящему от длины. Используя свободные энергии из подгонки Изинга, были рассчитаны свободные энергии сворачивания для массивов с увеличением числа повторений. При низком числе повторов полностью свернутое состояние конструкций NS-типа менее стабильно, чем конструкции HD-типа. Однако при большом количестве повторов конструкции NS-типа более стабильны, чем конструкции HD-типа. Точка пересечения находится между семью и восемью повторами. Чтобы увидеть эту фигуру в цвете, зайдите в интернет. См. это изображение и информацию об авторских правах в PMC Похожие статьи Функциональная нестабильность позволяет получить доступ к ДНК в более длинных массивах эффекторов, подобных активаторам транскрипции (TALE). Гейгер-Шуллер К., Митра Дж., Ха Т., Баррик Д. Гейгер-Шуллер К. и др. Элиф. 2019 27 февраля; 8: e38298. doi: 10.7554/eLife.38298. Элиф. 2019. PMID: 30810525 Бесплатная статья ЧВК. Делеция внутренних структурированных повторов увеличивает стабильность богатого лейцином повторного белка YopM. Vieux EF, Баррик Д. Vieux EF и др. Биофиз хим. 2011 ноябрь; 159(1):152-61. doi: 10.1016/j.bpc.2011.06.004. Epub 2011 22 июня. Биофиз хим. 2011. PMID: 21764506 Бесплатная статья ЧВК. Мутации, отличные от RVD, которые улучшают динамику массива повторов TAL вдоль суперспиральной оси, повышают эффективность редактирования генома TALEN. Точио Н., Умехара К., Уеваки Д.И., Флексиг Х., Кондо М., Дева Т., Сакума Т., Ямамото Т., Сайтох Т., Тогаси Ю., Тейт С.И. Точио Н. и др. Научный представитель 2016 г., 24 ноября; 6:37887. дои: 10.1038/srep37887. Научный представитель 2016. PMID: 27883072 Бесплатная статья ЧВК. Влияние увеличения количества повторов на специфичность связывания эффекторной ДНК TAL. Ринальди ФК, Дойл Л.А., Стоддард Б.Л., Богданове А.Дж. Ринальди ФК и др. Нуклеиновые Кислоты Res. 2017 Июн 20;45(11):6960-6970. дои: 10.1093/нар/gkx342. Нуклеиновые Кислоты Res. 2017. PMID: 28460076 Бесплатная статья ЧВК. Структурные основы взаимодействия эффектор-ДНК TAL. Бохтлер М. Бохтлер М. биол хим. 2012 г., октябрь; 393 (10): 1055-66. doi: 10.1515/hsz-2012-0164. биол хим. 2012. PMID: 23089535 Обзор. Посмотреть все похожие статьи Цитируется Раскрытие механики нанопружины повторяющегося белка: от складывания отдельных повторов до колебаний суперспирали. Синакевич М., Ипен Р.С., Перес-Риба А., Роулинг П.Дж.Э., Бауэр Д., Вайсль А., Фишер Г., Хивонен М., Риф М., Ицхаки Л.С., Стиглер Дж. Синакевич М. и соавт. АКС Нано. 2022 22 марта; 16 (3): 3895-3905. doi: 10.1021/acsnano.1c09162. Epub 2022 8 марта. АКС Нано. 2022. PMID: 35258937 Анализ фолдинга белков с тандемными повторами с использованием моделей ближайших соседей. Петерсен М., Баррик Д. Петерсен М. и соавт. Анну Рев Биофиз. 2021 6 мая; 50: 245-265. doi: 10.1146/annurev-biophys-102220-083020. Epub 2021 19 фев. Анну Рев Биофиз. 2021. PMID: 33606943 Бесплатная статья ЧВК. Обзор. Сборник программ для одномерного анализа Изинга белков с линейными повторами с точечными заменами. Марольд Д. Д., Сфорца К., Гейгер-Шуллер К., Аксель Т., Кляйн С., Петерсен М., Полякова-Георгантас Э., Баррик Д. Марольд Дж. Д. и др. Белковая наука. 2021 Январь; 30 (1): 168-186. doi: 10.1002/pro.3977. Epub 2020 2 ноября. Белковая наука. 2021. PMID: 33058322 Бесплатная статья ЧВК. Функциональная нестабильность позволяет получить доступ к ДНК в более длинных массивах эффекторов, подобных активаторам транскрипции (TALE). Гейгер-Шуллер К., Митра Дж., Ха Т., Баррик Д. Гейгер-Шуллер К. и др. Элиф. 2019 27 февраля; 8: e38298. doi: 10.7554/eLife.38298. Элиф. 2019. PMID: 30810525 Бесплатная статья ЧВК. Чрезвычайная стабильность в массивах повторов, разработанных de novo, определяется необычно стабильными короткодействующими взаимодействиями.