30.01.2023 | Leave a comment Содержание перевод на русский, синонимы, антонимы, произношение, примеры предложений, транскрипция, определение,значение, словосочетанияВарианты Варианты Синонимы Синонимы Предложения со словом «strengths» Going from strength to strength: перевод, значение, синонимы, произношение, транскрипция, антонимы, примеры предложений | HTML Translate | Англо-русский онлайн-переводчикПохожие слова: going from strength to strength Синонимы & Антонимы: не найдено Примеры предложений: Сила связывания фактора транскрипции модулирует ковариацию в транскрипционных сетях Стол 1 01 Европа PMC перевод на русский, синонимы, антонимы, произношение, примеры предложений, транскрипция, определение,значение, словосочетанияВарианты (v1)Варианты (v2)strength [streŋθ] сущсилаж, мощьж(force, power)inner strength – внутренняя силаgreat physical strength – большая физическая силаrelative strength index – индекс относительной силыstrength of heart contractions – сила сердечных сокращенийstrength of human spirit – сила человеческого духаmilitary strength – военная мощьпрочностьж, устойчивостьж, сопротивлениеср, стойкостьж, твердостьж(durability, stability, resistance, hardness)creep rupture strength – длительная прочностьhave sufficient strength – иметь достаточную прочностьmental strength – психологическая устойчивостьstrength of materials – сопротивление материаловcryptographic strength – криптографическая стойкостьнапряженностьж, интенсивностьж(tension, intensity)electric field strength – напряженность электрического полякрепостьж(fortress)strength of egypt – крепость египтачисленностьж(number)total strength – общая численностьдостоинствоср(advantage)мощностьж(capacity)maximum strength – максимальная мощностьсильная сторона(strong point)усилиеср(effort)nounсилаforce, power, strength, intensity, might, energyпрочностьstrength, durability, toughness, stability, hardness, solidityчисленностьstrengthкрепостьfortress, strength, stronghold, citadel, tower, bastionсопротивлениеresistance, resist, opposition, strength, stand, opposingчисленный составstrengthнеприступностьinaccessibility, impregnability, strengthСинонимы (v1) Синонимы (v2)strength сущforce · power · potency · energy · effect · numberdurability · firmness · fortitude · sturdiness · toughness · endurance · hardness · tenacitystability · soundness · resistance · robustness · sustainabilityintensity · tensionability · capabilityvigor · forcefulness · vigourstrong point · forte · strong suitvirtue · dignitynounpower, brawn, muscle, muscularity, burliness, sturdiness, robustness, toughness, hardiness, vigor, force, might, beef, thewhealth, fitness, vigor, staminafortitude, resilience, spirit, backbone, strength of character, courage, bravery, pluck, pluckiness, courageousness, grit, mettle, guts, spunkrobustness, sturdiness, firmness, toughness, soundness, solidity, durabilitypower, influence, dominance, ascendancy, supremacy, clout, puissanceintensity, vehemence, force, forcefulness, depth, ardor, fervorcogency, forcefulness, force, weight, power, potency, persuasiveness, soundness, validitystrong point, advantage, asset, forte, aptitude, talent, skill, specialtysize, extent, magnitudeforcefulness, forceeffectiveness, potencyintensitydurability, lastingness, enduringnesspersuasivenessposture, military capability, military strengthmetier, specialty, strong suit, strong point, forte, long suitПредложения со словом «strengths» The key to purpose is using your strengths to serve others. Основа предназначения — использование своей силы с пользой для других. Recognizing people isn’t one of my strengths due to a genetic visual impairment that has no correction or cure. Узнавание людей не является моей сильной стороной из — за нарушения зрения, которое не поддаётся лечению. Because we relied on our strengths , our best strengths , we achieved tremendous outcomes. Так как мы рассчитывали на свои силы, наши лучшие способности, мы добились потрясающих результатов. Then I thought, what if I could play with a computer — together with a computer at my side, combining our strengths , human intuition plus machine’s calculation, human strategy, machine tactics, human experience, machine’s memory. Тогда я подумал: а что, если сыграть вместе с компьютером, имея компьютер на своей стороне , объединив наши силы — человеческую интуицию с машинными расчётами, человеческую стратегию с машинной тактикой, человеческий опыт с машинной памятью? We, as the global health community policy experts, our first job is to become experts in how to monitor the strengths and vulnerabilities of health systems in threatened situations. Наша основная задача как экспертов по вопросам мировой политики в области здравоохранения — отслеживать сильные и слабые стороны системы здравоохранения в создавшихся опасных ситуациях. We have deductive reasoning, we have emotional intelligence, we have spatial intelligence, we have maybe 100 different types that are all grouped together, and they vary in different strengths with different people. Есть логика, есть эмоциональное мышление, есть пространственное, и ещё сотня других видов мышления, сгруппированных вместе, которые развиты по — разному у разных людей. Using the adversary’s own strengths and weaknesses as weapons. Использование сильных и слабых сторон противника в своих целях. I think school gave me not only knowledge but also a confidence in my strengths . Я думаю, что школа дала мне не только знания, но и уверенность в своих сильных сторонах . I hope seeing where your strengths and weaknesses lie will help motivate you. Я надеюсь, что понимание наших преимуществ и слабостей поможет с мотивацией. One tries to know their opposition and use their strengths and weaknesses against them. Всякий старается изучить своих противников и использовать против них их же силы и слабости. Over the past 10 years, local governments have built on their inherent strengths to become champions and facilitators of sustainable development. За последние 10 лет местные органы управления, используя присущие им преимущества, превратились в активных участников и сторонников устойчивого развития. Over the past two years, the ad hoc advisory groups have built on these strengths . В последние два года специальные консультативные группы продолжали применять эти эффективные методы работы. Despite these strengths , families everywhere are under pressure. Несмотря на всю эту силу, повсюду, тем не менее, существуют семьи, находящиеся в тяжелом положении. A holistic approach calling on the relative strengths of the different international organizations is vital. Применение целостного подхода, предусматривающего использование относительных преимуществ различных международных организаций имеет исключительно важное значение. That said, civil society tends to be treated as a monolithic entity, without sufficient understanding of its diversity, its strengths and its weaknesses. Учитывая сказанное, следует отметить, что существует тенденция относиться к гражданскому обществу как к единому целому, без достаточного понимания его многообразия, его сильных и слабых сторон . The United Nations has inherent strengths and advantages as an instrument of multilateral development cooperation that cannot be duplicated. Организация Объединенных Наций как инструмент многостороннего сотрудничества в области развития обладает рядом органически присущих ей достоинств и преимуществ. The main strengths of the programme lie in its capacity- building aspect. Сильной стороной программы является деятельность по формированию потенциала. Those reports give us an overall view of how relations are developing, highlighting strengths but also weaknesses. Эти доклады дают нам общее представление о том, как развиваются отношения, освещают как сильные , так и слабые стороны . But strength alone is not enough to carry the day against an adversary who specializes in turning our strengths into weaknesses. Но одной силы недостаточно, чтобы одержать победу над противником, который специализируется на превращении наших сильных сторон в слабые. A more objective measure of the relative strengths of MiG and Sabre are the number of enemy aircraft each shot down, but these kill ratios have been hard to pin down. Более объективным показателем относительной силы истребителей МиГ и «Сейбр» является количество сбитых самолетов противника, однако подобного рода данные о соотношении потерь трудно получить. The first is a unique and up-to-date learning profile of every student’s strengths , weaknesses, motivations and goals. Первый аспект — это уникальный и актуальный учебный профиль сильных и слабых мест, а также мотивов и целей каждого учащегося. Countering provocations or pressure by adversary states like Russia should be formulated on Western strengths , and not dictated by the adversary. Противодействие провокациям или давлению со стороны таких враждебных государств, как Россия, следует выстраивать, ориентируясь на преимущества Запада, а не на те, что диктует противник. One-piece carbon-carbon thrust chambers or one-piece carbon-carbon exit cones with densities exceeding 1.4 g/cm3 and tensile strengths exceeding 48 MPa. Монолитные камеры сгорания или монолитные выхлопные конические насадки сопла из материала углерод — углерод плотностью более 1,4 г/куб.см и прочностью на разрыв более 48 МПа. We encourage them to talk about their interests, rather than expecting them simply to answer typical questions about their employment goals or to list their strengths and weaknesses. Мы побуждаем их говорить о своих интересах, вместо того чтобы просто требовать от них ответов на стандартные вопросы о том, для чего они устраиваются на эту работу или каковы их сильные и слабые стороны . If people can consciously recognize the strengths and weaknesses in their ways of thinking, they can then seek out the right kinds of minds for the right reasons. Если бы люди могли сознательно принять сильные и слабые стороны своего мышления, они получили бы возможность находить людей с нужным типом мышления для выполнения определенных задач. It’s an approach to teaching predicated on keen understanding of an individual student’s strengths , weaknesses and goals. Это такой подход к обучению, который основан на глубоком понимании индивидуальных целей, а также сильных и слабых сторон конкретного студента. Everyone has strengths and weaknesses. У каждого есть сильные и слабые стороны . FACTOR TWO — Index Strengths and Weaknesses Фактор второй — сила и слабость индекса Unfortunately for both, their main strengths — transmitting information and connecting people — happen to be what the Internet does best. К сожалению для обоих, их основные силы — передача информации и объединение людей — это как раз то, что Интернет делает лучше. That has been one of the invisible strengths of NATO that many people in the outside world don’t see. Одна из невидимых сильных сторон НАТО состоит в том, чего многие люди во внешнем мире не видят. So I hope you’ll use the information I’ve given you today to weigh your personal strengths against your own risk factors. Я надеюсь, что то, о чем я рассказала сегодня, заставит вас взвесить собственные силы в борьбе с факторами риска. And we think there’s a recipe for it, and it’s knowing what your highest strengths are. Мы считаем, что для достижения этого есть свой рецепт. Первое: установить, в чём состоит ваша сильная сторона — Let them think it is irrational to systematically advance national and personal interests by identifying weaknesses and playing to strengths . Что иррационального в том, чтобы систематически продвигать национальные и личные интересы, используя чужие слабости и свои сильные стороны ? In her analysis, it serves everyone for men and women to share their sometimes different but often complementary strengths – a conclusion that seems reassuring, not oppressive. В своем анализе она показывает, что для мужчин и женщин выгодно совместно использовать свои иногда разные, но часто дополняющие друг друга сильные стороны – заключение, которое выглядит обнадеживающим, а не гнетущим. Yet if restraint can therefore be a valuable commodity, the activist approach also has strengths to commend it. Но если сдержанность может быть ценным товаром, то и активистский подход обладает определенными преимуществами. While the UN still has many strengths , it also has clear structural weaknesses. У ООН по — прежнему много сильных стороны , но у неё есть и очевидная структурная слабость. Now, not to pat myself on the back, but one of my strengths is understanding people, intuiting their needs. Я не хочу нахваливать себя, но одна из моих сильных сторон — понимать людей, чувствовать их нужды. He had been a professional criminologist for fifteen years, and he prided himself that one of his strengths was his ability to assess prisoners. Он уже 15 лет занимался криминалистикой и гордился, что одной из его сильных сторон была способность оценить заключенного. Somewhere in there, you gotta show them your strengths . Speed, agility, flexibility. Значит, надо доказать им, какой ты быстрый, сильный , ловкий и гибкий. Your only genetic weakness amidst so many new strengths . Ваша единственная слабость среди такого массива сил. Everybody brings their own unique strengths to the table. Все привносят свои особые сильные стороны . For this song, each of the contenders… have been given lines that play to their strengths vocally. В этой песне каждому из участников были даны строчки, которые лучше всего демонстрируют их вокальные данные. Unhinging a man with all his strengths and weaknesses is tough. Воздействие на мозги человека со всеми его потрохами и слабостями — трудная работа. I know his strengths , I know his pride, and I know his house, every nook and cranny. Я знаю его силы, я знаю его гордость, и я знаю каждый угол в его доме. We had a small team at Bianca’s noting the number of guards who responded, how quickly they arrived, their maneuvers, their strengths , and especially their weaknesses. У нас была небольшая команда в доме Бьянки, они отмечали количество прибывших охранников, как быстро они прибыли, их действия, их сильные и особенно — слабые стороны . Let’s begin with an honest self-appraisal… assess your strengths and weaknesses. Давай начнем с честной самооценки… оценим твои сильные и слабые стороны , так скажем. Where I believe you’ve shown profound strengths as a Designer is in your ability to step back and look at your work and edit. Поскольку я верю, что ты показываешь сильный дизайн, то ты должна отстраниться, взглянуть на свою работу и подправить её. And you’re more of a caregiver, and I have… other strengths . Ты заботишься о людях, а я… у меня есть другие сильные стороны . He was born with an atrophied left leg, his legs are of different lengths as well as different strengths . Он родился с атрофией левой ноги, его ноги имеют разную длину и различную силу. When you applied to the FBI, we constructed psychological profiles of you… breakdowns of your mental strengths and emotional weaknesses. Когда вы подали заявление в ФБР, мы составили ваш психологический профиль… выделили вашу психологическую устойчивость и эмоциональные слабости. In its long history, one of the enduring strengths of the Church has been its capacity to withstand persecution, insult and ridicule. На протяжении всей истории одной из самых сильных черт церкви было ее умение противостоять гонениям, оскорблениям и высмеиваниям. This… just, um… this could be a… a theoretical long shot, but the lock you just described is as tight as a drum, which has its strengths and weaknesses. Это… просто… ммм… это может быть . .. теоретически долгий случай но замок который вы охарактеризовали как натянутый как барабан имеет свои сильные и слабые стороны The challenge is picking something that plays to our collective strengths , and that won’t set off a firestorm in the community like Rocky Horror did. Основная задача — выбрать что — то что отображает наши сильные стороны И не вызовет такого резонанса в обществе как Роки Хоррор And the way you get the best out of people is to make room for their strengths , not by overcompensating for their weaknesses. И лучшие результаты будут, если делать упор на сильные стороны людей. А не компенсируя их слабости. I factored in my many considerable strengths , but… their numbers are correct. Я включила в расчеты мои многочисленные важные преимущества, но… их цифры верны. As Germans, we know our industrial strengths . But you know our weaknesses. Вы знаете, каковы слабые стороны немецкой промышленности? My strengths are development, management and negotiation, which clearly you don’t have or else you’d be worth $2 million right now, wouldn’t you? Мой конек — это развитие, менеджмент и ведение переговоров, чего у тебя очевидно нет иначе, прямо сейчас ты бы стоил 2 миллиона долларов, не так ли? Of us… combining our strengths , and becoming powerful together. Что мы объединяемся для того, чтобы стать сильными вместе. These are the two sides the dual strengths , the essential opposites that characterize human thinking. Человеческое мышление характеризуется именно этими двумя одинаково сильными и важными противоположностями. When you feel overconfident, you forget that your enemy has strengths , too. Когда слишком уверен в себе, то забываешь, что у врага тоже есть силы.Going from strength to strength: перевод, значение, синонимы, произношение, транскрипция, антонимы, примеры предложений | HTML Translate | Англо-русский онлайн-переводчикOpenTran — Онлайн-переводчик & словарьТолковый словарьПолитика конфиденциальностиЗначениеСинонимыАнтонимыПроизношениеТранскрипцияПримеры предложений RU AF AM AR AZ BE BG opentran.net» data-lang=»bn»> BN BS CA CEB CN CO CS CY DA DE EL EN EO ES ET EU FA FI FR FY opentran.net» data-lang=»ga»> GA GD GL GU HA HAW HI HMN HR HT HU HY ID IG IS IT IW JA JW KA opentran.net» data-lang=»kk»> KK KM KN KO KU KY LA LB LO LT LV MG MI MK ML MN MR MS MT MY opentran.net» data-lang=»ne»> NE NL NO NY OR PA PL PS PT RO RU RW SD SI SK SL SM SN SO SQ opentran.net» data-lang=»sr»> SR ST SU SV SW TA TE TG TH TK TL TR TT UK UR UZ VI XH YI YO opentran.net» data-lang=»zu»> ZUgoing from strength to strengthпереходя от силы к силеTranslateGB Похожие слова: going from strength to strength from, from singles, from remote sensing, from the baltic, from $5 upwards, from 0 pips, from 0 through 9, from 0 to 10, from 00 to 30, from 03.12.2012, from 07:00 till, from 08:00 till, from 09:00am, from 1 april, from 1 august, from 1 december, from 1 euro, from 1 february, from 1 ghz, from 1 january onwards Синонимы & Антонимы: не найдено Примеры предложений: going from strength to strength I’m not a prophet… but i know that our people will keep going forward… all together, with all of our strength. Я не пророк… но я знаю, что наш народ будет идти вперед… все вместе, изо всех сил. I was going to get you glasses so people would know which way you were facing! Я собиралась купить тебе очки, чтобы люди знали, в какую сторону ты смотришь! Now I want you to break out your pink rolodex, call every queer assistant in town and tell them to open their mouths like J.T. is going to drop a load in it. А теперь я хочу, чтобы ты достала свой розовый ролодекс, обзвонила всех педиков — ассистентов в городе и сказала им, чтобы они открыли рты, как будто Джей — Ти собирается бросить в них груз. I’m going to come back and help you as soon as I can. Я вернусь и помогу вам, как только смогу. I thought I wasn’t going to be able to do that by myself. Я думал, что не смогу сделать это в одиночку. What if Pell regards your silence as weakness rather than strength ? Что, если Пелл сочтет твое молчание слабостью, а не силой? Well if the oxygen is going to diffuse into those liquids, then I would say the partial pressure of oxygen in the liquid would go up. Ну, если кислород собирается диффундировать в эти жидкости, то я бы сказал, что парциальное давление кислорода в жидкости повысится. Where did Tom and Mary tell you they were going ? Куда Том и Мэри сказали вам, что собираются? I didn’t know you were going to be in Boston this week. Я не знал, что ты будешь в Бостоне на этой неделе. I don’t think we’re ever going to find out who did that. Я не думаю, что мы когда — нибудь узнаем, кто это сделал. To make amends, you are all going to kiss his little foot, as a sign of love and submission. Чтобы загладить свою вину, вы все будете целовать его маленькую ножку, как знак любви и покорности. I think it’s very obvious what’s going to happen. Я думаю, что совершенно очевидно, что должно произойти. I know there are going to be setbacks as well as victories. Я знаю, что будут и неудачи, и победы. It was specifically brought to the attention of editors and they simply made it clear that they were not going to report it.There is no question about the facts incidentally. Это было специально доведено до сведения редакторов, и они просто дали понять, что не собираются сообщать об этом.Кстати, о фактах не может быть и речи. It seems that he has less strength at some point in time. Похоже, что в какой — то момент у него стало меньше сил. I think that Tom would’ve been here today if he’d known Mary was going to b here. Я думаю, что Том был бы здесь сегодня, если бы знал, что Мэри будет здесь. Or are you just going to pin a bloody tampon to his lapel? Или ты просто прикалываешь окровавленный тампон к его лацкану? Tom is going to come to Australia next Monday and stay for three weeks. Том собирается приехать в Австралию в следующий понедельник и остаться там на три недели. I had a whole ceramic zoo thing going over there. У меня там был целый керамический зоопарк. You going to the tropical fish market? Собираетесь на рынок тропических рыб? And as long as I gave you access to my body… you were satisfied that the marriage was going well. И пока я давала тебе доступ к моему телу… ты был уверен, что брак идет хорошо. Tell everyone you fell and skinned your knees… going to the public convenience. Скажи всем, что ты упал и ободрал колени. .. иду к общественному удобству. And he was going to tell you the last time that you saw him. И он собирался сказать тебе, когда ты видела его в последний раз. Everything is the same, so this number is going to be greater. Все то же самое, значит, это число будет больше. In a twinkling, hormones have helped to equip you to perform feats of strength and endurance far beyond your normal ability. В мгновение ока гормоны помогли подготовить вас к выполнению подвигов силы и выносливости, намного превосходящих ваши обычные способности. Something not quite normal, anything to explain what might be going on. Что — то не совсем нормальное, что — то, что могло бы объяснить происходящее. You’ve been in an accident, but you’re going to be all right. Вы попали в аварию, но с вами все будет в порядке. Tom is probably going to be charged with perjury. Тому, вероятно, предъявят обвинение в лжесвидетельстве. Where are the babe and the boy going ? Куда идут ребенок и мальчик? While there is some benefit in silently reviewing what you are going to say, many find it more helpful to rehearse their presentation out loud. Хотя есть некоторая польза в молчаливом рассмотрении того, что вы собираетесь сказать, многие считают более полезным репетировать свою презентацию вслух. I think we’re going to be able to do that before Monday. Думаю, мы сможем это сделать до понедельника. Copyright© OpenTran Сила связывания фактора транскрипции модулирует ковариацию в транскрипционных сетях Список журналов Рукописи авторов HHS PMC2826431 Тенденции Жене. Авторская рукопись; доступно в PMC 2011 1 февраля. Опубликовано в окончательной редакции как: Trends Genet. 2010 февраль; 26(2): 51–53. Published online 2010 Jan 18. doi: 10.1016/j. tig.2009.12.005 PMCID: PMC2826431 NIHMSID: NIHMS167310 PMID: 20080313 , 1 , 1 and 2 Информация об авторе Информация об авторских правах и лицензии Отказ от ответственности Дополнительные материалы Заметная часть транскриптома различается по уровню экспрессии у разных людей. Экспрессия фактора транскрипции (TF) и связывание ДНК вызывают клеточно-специфическую активацию и репрессию нижестоящих мишеней, а уровни экспрессии TF различаются у разных людей. Однако неясно, как сила связывания ДНК для отдельных TF транслируется в регуляторный контроль, или используется ли другой набор мотивов связывания для строго регулируемых модулей. Здесь мы объединяем два общедоступных набора данных в Drosophila melanogaster , а также провести новый анализ для решения этих вопросов. Все мухи не рождаются одинаковыми; геномы двух неродственных особей, случайно выбранных из естественной популяции, отличаются более чем на 1 МБ ДНК [1]. Даже с несовершенными инструментами для измерения уровней экспрессии различия в уровне транскриптов между генотипами также очевидны для ~10% транскриптома всего тела [2, 3]. Часть этой изменчивости экспрессии может быть нейтральной, что компенсируется за счет избыточной структуры генетических сетей. Временные вредные или полезные мутации, находящиеся на пути к тому, чтобы быть отобранными из популяции или закрепленными, могут объяснить некоторую изменчивость. Наконец, некоторая изменчивость может быть полезной в подмножестве среды обитания мух, полов или социальных групп и, следовательно, поддерживаться благодаря уравновешивающему отбору. Исходя из общих принципов, можно ожидать меньших вариаций в экспрессии во время раннего эмбрионального развития. Отклонения могут быть чаще вредными, чем нейтральными, так как этот этап важен для формирования базовой структуры организма. Мы, однако, обнаружили множество вариаций экспрессии среди девяти гомозиготных генотипов в течение 5- и 8-часовых временных точек раннего развития, в том числе в генах сегментации и их нижестоящих мишенях [4]. Помимо наследственных различий, может быть несколько причин этой изменчивости, включая материнские условия, отклонения во времени развития яиц, другие экологические и генетические факторы и взаимодействия между ними. Независимо от того, каковы причины изменчивости, они дают нам инструменты для изучения того, как гены взаимодействуют друг с другом. Мы обнаружили, что ТФ и гены, которые они контролируют, были затронуты. Из 5065 генов, экспрессированных в большинстве линий, 3754 продемонстрировали значительные различия между линиями в обе временные точки при P <0,05 (что соответствует частоте ложных открытий 6,7%). Когда гены регулируют друг друга, уровни их транскриптов часто оказывают совместное влияние или они ко-вариабельны.0014 среди генотипов: например, более высокая экспрессия вышестоящих генов соответствует более высокой экспрессии известных нижестоящих генов. Мы наблюдали сходные паттерны в каскаде альтернативного сплайсинга, который имеет место при определении пола [5]. Хотя корреляция не равна причинности, мы склонны предположить, что большее количество фактора транскрипции (или сплайсинга) приводит к более сильной активации или репрессии (или более эффективному сплайсингу) нижестоящей мишени. Здесь мы оцениваем эту гипотезу, используя общедоступные данные о силе связывания TF с тысячами их нижестоящих мишеней. Регуляторный каскад сегментации, возможно, является одним из наиболее изученных путей у Drosophila melanogaster . Долгое время считалось, что ТФ в этом каскаде специфически взаимодействуют с несколькими мишенями [6]. Несколько недавних исследований поставили под сомнение эту точку зрения в отношении этих и других ТФ [7, 8, 9, 10]. Эксперименты по иммунопреципитации хроматина (ChIP) приводят к совместной очистке специфических факторов транскрипции и фрагментов ДНК, с которыми они связаны in vivo . Эту очищенную ДНК можно гибридизовать с мозаичным микрочипом (ChIP-chip) или напрямую секвенировать (ChIP-Seq) для обнаружения связанных областей всего генома. Интенсивность гибридизации ChIP-очищенной ДНК с микрочипом служит показателем силы связывания с каждым связанным сайтом [8]. Изученные до сих пор TF, по-видимому, сильно связаны с тысячами регуляторных регионов и более слабо связаны с десятками тысяч других сайтов. Хотя это наблюдение удивительно, оно не является неожиданным. Большинство эукариотических ТФ распознают короткие вырожденные мотивы ДНК, которые часто встречаются по всему геному. Из термодинамических соображений ожидается, что большинство молекул ТФ связаны с ДНК в ядре, а не находятся в растворе в свободном состоянии. Так как многие факторы бластодермы присутствуют в концентрациях многих десятков тысяч молекул на клетку, они должны связываться с любыми последовательностями распознавания от умеренного до высокого сродства, которые они могут найти [8]. Тогда возникает вопрос, какая часть этих сайтов связывания регулирует гены. Одна из гипотез заключается в том, что многие сайты с высоким сродством важны для регуляции и что клеточный механизм каким-то образом способен игнорировать связывание с сайтами с более низким сродством [10]. Используя данные о совместной вариации экспрессии между регуляторами и мишенями, мы задались вопросом, опосредует ли сила связывания регуляторный эффект TF на прямые мишени. Мы сосредоточились на объединении двух наборов данных. От одного из них [4] мы получили информацию об уровне экспрессии ТФ и всех генов, которые они предположительно регулируют. Представьте, например, что в некоторых из девяти генотипов Bcd экспрессируется на более высоких уровнях по сравнению с остальными генотипами. Если Bcd активирует нижележащие мишени способом, зависящим от уровня его экспрессии [11], мы можем надеяться обнаружить более высокую экспрессию гена-мишени в высоком генотипов Bcd (если действует как активатор). Второй набор данных, который мы извлекаем, относится к силе связывания нескольких из этих же сегментационных TF с их нижележащими мишенями [8]. Если наша гипотеза о том, что Bcd регулирует только сильно связанные сайты, но не влияет на экспрессию через слабо связанные сайты, верна [10], то активация Bcd должна влиять на расположенные ниже по течению гены, которые сильно связаны, эффективно игнорируя более слабо связанные мишени. . Мы объединили наборы данных для пяти TF, изученных в Ref. [8] — материнские факторы Bicoid и Caudal , а также зиготические факторы Hunchback, Kruppel и гигантский — и их предполагаемые нисходящие мишени ( knirps был исключен из-за небольшого числа высокодостоверных связанные области). Для каждой пары TF-мишень мы использовали два измерения: ковариацию уровней экспрессии среди генотипов [4] и силу связывания TF [8]. Мы предположили, что ковариация и сила должны сами по себе ковариации. В соответствии с этой гипотезой мы обнаружили очень значимые корреляции для всех пяти факторов транскрипции (дополнительный рисунок 1). (Обратите внимание, что P -значения основаны на предположении о независимости уровней экспрессии генов, что является типичным предположением, но не обязательно верным [3]). Для сравнения мы также спросили, существует ли связь между ковариацией экспрессии между ТФ и их мишенями и расстоянием от ближайшей связанной области до гена-мишени. Только одно из пяти сравнений было незначительно значимым, и все корреляции имели значительно меньшую величину (1). Стол 1 Взаимосвязь между ковариацией экспрессии и свойствами связывания Фактор транскрипции Роль Количество сайтов связывания Корреляция с силой связывания (значительность) с расстоянием между генами Корреляция с количеством сайтов связывания (значимость) Bcd материнский 692 0. 193 (1.08×10 -5 ) 0.026 (0.56) 0.006 (0.89) Cad maternal 1331 0.109 (1.34×10 -3 ) 0,033 (0,34) -0,029 (0,39) GT Zygotic 966 0,106 (6,83 × 10 -3 9028) 0,106 (6,83 × 10 -3 ) 0,106 (6,83 × 10 -3 ) 0,106. 0,074 (0,058) гб zygotic 1788 0.106 (2.59×10 -4 ) 0.051 (8.04×10 -2 ) 0.005 (0.85) Kru zygotic 2900 0,230 (2,20 × 10 -16 ) 0,009 (0,71) 0,123 (1,58 × 10 -7 ) Open в отдельном окне Open в отдельном окон Сила связывания и ковариация в экспрессии низки, но приведенные выше ожидания явно наивны на многих уровнях. Во-первых, TF действует сложным образом в пространстве и времени, и однозначное соответствие в образцах РНК, извлеченных из цельных яиц, было бы удивительно обнаружить. Во-вторых, что, возможно, более важно, TFs проявляют как прямой, так и косвенный контроль над сотнями генов. Этот непрямой контроль может привести к высокой ковариации в экспрессии даже с генами, которые очень слабо связаны самими TF, но могут быть сильно связаны промежуточным белком. Кроме того, многие из этих TF контролируют одни и те же гены, и существует значительное перекрытие (иногда до 80% [8]) между связанными областями для пяти транскрипционных факторов. Хотя это перекрытие не меняет ни одну из корреляций, указанных в , это может означать, что каждая из них не представляет собой независимую точку данных. В любом случае мы заключаем, что TF влияют на экспрессию своих нижестоящих мишеней, при этом сила связывания является механистически обоснованным предиктором силы этого эффекта, что подтверждает вышеуказанную гипотезу [10]. Потребуются более крупные эксперименты с более высокой мощностью, чтобы проверить, не регулируются ли слабо связанные сайты или слабо регулируются. Хотя эти анализы демонстрируют предполагаемую взаимосвязь между силой связывания и регулирующим контролем, они не раскрывают механизм(ы), с помощью которых осуществляется регулирующий контроль. Предыдущие анализы показали, что сила связывания TF коррелирует с количеством мотивов сайтов связывания для конкретного TF, обнаруженных в связанных областях [8]. Мы также предположили, что могут быть специфические мотивы сайта связывания, чрезмерно представленные в связанных областях, фланкирующих гены, которые демонстрируют сильный регуляторный контроль со стороны TF, обеспечивая механистическую связь с регуляторным контролем. Для всех пяти ТФ, рассмотренных выше, мы подсчитали количество мотивов ДНК в высокодостоверно связанных областях, которые были значимыми совпадениями ( P <0,05) с экспериментально определенными матрицами позиционно-специфических весов (PSWM) с использованием программы Patser [ 12]. Хотя подавляющее большинство связанных областей действительно содержало узнаваемый мотив, соответствующий PSWM, не все. Сначала мы задались вопросом, более ли вероятно, что транскрибированные гены, наиболее близкие к связанным областям, содержащие хотя бы один мотив связывания, будут демонстрировать ковариацию в экспрессии с их TF. Для 4 из 5 TF наблюдалась очень значимая взаимосвязь: гены, фланкированные областями, не содержащими сайтов связывания, с меньшей вероятностью на 75% ковариировались с TF (дополнительная таблица 1). Среди связанных областей, которые содержат значительное совпадение сайтов связывания ДНК для каждого TF (т.е. PSWM), мы затем спросили, существует ли значительная разница в нуклеотидах, используемых в каждом положении сайта связывания между генами, или не коррелируют с их TF. Мы использовали программу Two Sample Logo [13] для проверки различий (используя как тест t , так и полиномиальное выборочное распределение) и обнаружили значительное избыточное или недостаточное представительство специфических нуклеотидов в 4 из 5 сайтов связывания ТФ. (и дополнительный рисунок 2). Эти различия указывают на специфические нуклеотиды, которые с большей или меньшей вероятностью могут быть обнаружены в мотивах связывания, фланкирующих гены, находящиеся под сильным регуляторным контролем, но не идентифицируют целые мотивы, связанные со строго регулируемыми генами. Чтобы найти такие мотивы, мы искали специфические последовательности, соответствующие PSWM, которые обнаружены в избытке в тех связанных областях, фланкирующих гены, которые значительно ко-вариантны с каждым TF. Принимая во внимание только мотивы, обнаруженные как минимум 10 раз, мы обнаружили только один мотив, который был значительно перепредставлен: GGAAATTTTATTAC более чем в три раза чаще использовался рядом с генами, сильно регулируемыми Каудальный , чем в связанных областях, не связанных с регуляторным контролем ( P =1,5×10 -7 , χ 2 -тест). В целом, эти результаты показывают, что существуют специфические сигналы ДНК, связанные с регуляцией транскрипции, которые не очевидны при простом сравнении связанных и несвязанных областей. Открыть в отдельном окне Чрезмерное и недостаточное количество нуклеотидов в мотивах сайта связывания. На графике показаны те нуклеотиды, которые представлены либо в избытке («обогащенные»), либо в недостаточной степени («истощенные») в мотивах, обнаруженных в связанных областях, фланкирующих гены, которые ко-вариантны с фактором транскрипции 9.0013 Гигант . Высота каждой буквы представляет собой степень избыточного или недостаточного представления, а буквы между двумя строками представляют инвариантные позиции (например, буква «А» в позициях 7 и 8 мотива переплета). Все показанные нуклеотиды значимы при P <0,05. Современные геномные технологии позволяют генерировать тысячи генов-кандидатов для многих биологических процессов, но проверка этих кандидатов до сих пор, как правило, осуществляется путем изменения гена за геном. Однако изменчивость, обнаруженная в природе, представляет собой многофакторный эксперимент по возмущению, который потенциально дает нам инструменты для мультигенной проверки, если мы сможем правильно связать генотип с фенотипом [14]. Здесь мы показали, что паттерны ковариации между факторами транскрипции и их генами-мишенями могут установить предсказательную силу силы связывания и мотивов связывания для силы регуляторного контроля. Будущие эксперименты с использованием естественной изменчивости позволят нам создать причинно-следственные сети, лежащие в основе важных фенотипов. 01 Нажмите здесь для просмотра. (292K, doc) Мы благодарим C. Ganote за помощь и S. MacArthur за предоставление весовых матриц для конкретных позиций. Авторы поддерживаются грантом NIH R01-GM076643. Отказ от ответственности издателя: Это PDF-файл неотредактированной рукописи, которая была принята к публикации. В качестве услуги нашим клиентам мы предоставляем эту раннюю версию рукописи. Рукопись будет подвергнута редактированию, набору текста и рецензированию полученного доказательства, прежде чем она будет опубликована в ее окончательной цитируемой форме. Обратите внимание, что в процессе производства могут быть обнаружены ошибки, которые могут повлиять на содержание, и все правовые оговорки, применимые к журналу, относятся к нему. 1. Бегун Д.Дж. и др. Популяционная геномика: полногеномный анализ полиморфизма и дивергенции у Drosophila simulans . PLoS биол. 2007; 11: 2534–2559. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] 2. Jin W, et al. Вклад пола, генотипа и возраста в транскрипционную изменчивость у Drosophila melanogaster . Природа Жене. 2001; 29: 389–395. [PubMed] [Google Scholar] 3. Нуждин С.В. Общая закономерность эволюции уровня экспрессии генов и последовательности белков у Дрозофила . Мол Биол Эвол. 2003; 21:1308–1317. [PubMed] [Google Scholar] 4. Нуждин С.В., и соавт. Обильные генетические вариации на уровне транскриптов во время раннего развития Drosophila . Эвол Девелопмент. 2008; 10: 683–689. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] 5. Tarone AM, et al. Генетическая изменчивость экспрессии генов пути определения пола у Drosophila melanogaster . Генет Рез. 2005; 86: 31–40. [PubMed] [Академия Google] 6. Дэвидсон Э.Х. Геномные регуляторные системы. Академическая пресса; 2001. [Google Scholar] 7. Zeitlinger J, et al. Анализ полногеномных чипов Dorsal, Twist и Snail предполагает интеграцию разнообразных процессов формирования паттерна в эмбрионе Drosophila . Гены развиваются. 2007; 21: 385–390. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] 8. Li X, et al. Факторы транскрипции связывают тысячи активных и неактивных областей в бластодерме Drosophila . PLoS биол. 2008;6:e27. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] 9. Sandman T, et al. Основная транскрипционная сеть для раннего развития мезодермы у Drosophila melanogaster . Гены развиваются. 2009; 21: 436–449. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] 10. MacArthur S, et al. Роль в развитии 21 фактора транскрипции Drosophila определяется количественными различиями в связывании с перекрывающимся набором из тысяч геномных регионов. Геном биол. 2009;10:R80. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] 11. Schroeder MD, et al. Транскрипционный контроль в сети генов сегментации Drosophila . PLoS биол. 2004;2:e271. [бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] 12. Программный пакет Patser (http://ural.wustl.edu/resources.html). 13. Вацич В., Якучева Л.М., Радивояц П. Два образца логотипа: графическое представление различий между двумя наборами выравниваний последовательностей. Биоинформатика. 2006; 22:1536–1537. [PubMed] [Академия Google] 14. Рокман М.В. Обратное проектирование карты генотип-фенотип с естественной генетической изменчивостью. Природа. 2008; 456: 738–744. [PubMed] [Академия Google] Европа PMC 1. Тейхманн С., Бабу М.М. Рост регуляторной сети генов за счет дупликации. Генетика природы. 2004; 36: 492–496. [PubMed] [Google Scholar] 2. Иннан Х., Кондрашов Ф. Эволюция дупликаций генов: классификация и различие между моделями. Нат Рев Жене. 2010; 11:97–108. [PubMed] [Академия Google] 3. Оно С. Эволюция путем дупликации генов. Аллен и Анвин; Спрингер-Верлаг; Лондон, Нью-Йорк: 1970. [Google Scholar] 4. Lynch M, Conery JS. Эволюционная судьба и последствия дублирования генов. Наука. 2000; 290:1151–1155. [PubMed] [Google Scholar] 5. Lan X, Pritchard JK. Корегуляция тандемных дубликатов генов замедляет эволюцию субфункционализации у млекопитающих. Наука. 2016; 352:1009–1013. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] 6. Вапински И., Пфеффер А., Фридман Н., Регев А. Естественная история и эволюционные принципы удвоения генов у грибов. Природа. 2007;449: 54–61. [PubMed] [Google Scholar] 7. Force A, et al. Сохранение дубликатов генов путем комплементарных дегенеративных мутаций. Генетика. 1999; 151:1531–1545. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] 8. Wheeler JC, Shigesada K, Gergen JP, Ito Y. Механизмы регуляции транскрипции доменными белками Runt. Semin Cell Dev Biol. 2000; 11:369, 369–375. [PubMed] [Google Scholar] 9. Леванон Д. Пространственная и временная картина экспрессии Runx3 (Aml2) и Runx1 (Aml1) указывает на неповторяющиеся функции во время эмбриогенеза мыши. Мех Дев. 2001;109: 413–417. [PubMed] [Google Scholar] 10. Goyama S, et al. Транскрипционно активная форма AML1 необходима для гематопоэтического спасения AML1-дефицитной эмбриональной парааортальной спланхноплевральной (P-Sp) области. Кровь. 2004; 104:3558–3564. [PubMed] [Google Scholar] 11. Weirauch MT, et al. Определение и вывод о специфичности последовательности эукариотического фактора транскрипции. Клетка. 2014; 158:1431–1443. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] 12. Berg OG, von Hippel PH. Выбор сайтов связывания ДНК регуляторными белками. Статистико-механическая теория и применение к операторам и промоутерам. Дж Мол Биол. 1987;193:723–750. [PubMed] [Google Scholar] 13. Hentsch B, Mouzaki A, Pfeuffer I, Rungger D, Serfling E. Слабое, точно настроенное связывание вездесущих транскрипционных факторов с энхансером IL-2 способствует его ограничению Т-клетками. Мероприятия. Нуклеиновые Кислоты Res. 1992; 20: 2657–2665. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] 14. Jiang J, Levine M. Сродство связывания и кооперативные взаимодействия с активаторами bHLH ограничивают пороговые ответы на морфоген дорсального градиента. Клетка. 1993;72:741–752. [PubMed] [Google Scholar] 15. Gaudet J, Mango SE. Регуляция органогенеза Caenorhabditis elegans белком FoxA PHA-4. Наука. 2002; 295:821–825. [PubMed] [Google Scholar] 16. Scardigli R, Baumer N, Gruss P, Guillemot F, Le Roux I. Прямая и зависимая от концентрации регуляция пронейрального гена Neurogenin2 с помощью Pax6. Разработка. 2003; 130:3269–3281. [PubMed] [Google Scholar] 17. Танай А. Обширные низкоаффинные транскрипционные взаимодействия в геноме дрожжей. Геном Res. 2006;16:962–972. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] 18. Rowan S, et al. Точный временной контроль регуляторного гена глаза Pax6 посредством сродства к сайту связывания энхансера. Гены Дев. 2010; 24:980–985. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] 19. Crocker J, et al. Кластеры сайтов связывания с низким сродством придают hox-специфичность и устойчивость к регуляции. Клетка. 2015; 160:191–203. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] 20. Farley EK, et al. Субоптимизация усилителей развития. Наука. 2015; 350:325–328. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] 21. Cannavò E. Генетические варианты, регулирующие уровни экспрессии и разнообразие изоформ во время эмбриогенеза. Природа. 2017; 541:402–406. [PubMed] [Google Scholar] 22. Crocker J, Noon EP, Stern DL. Мягкое прикосновение: сайты связывания факторов транскрипции с низким сродством в развитии и эволюции. Curr Top Dev Biol. 2016; 117: 455–469. [PubMed] [Google Scholar] 23. Нуждин С.В., Рычкова А., Хан М.В. Сила связывания фактора транскрипции модулирует ковариацию в транскрипционных сетях. Тенденции Жене. 2010;26:51–53. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] 24. Браво Дж., Ли З., Спек Н.А., Уоррен А.Дж. Бета-комплекс AML1 (Runx1)-CBF, связанный с лейкемией, функционирует как ДНК-индуцированный молекулярный зажим. Nat Struct Biol. 2001; 8: 371–378. [PubMed] [Google Scholar] 25. Tahirov TH, et al. Структурный анализ распознавания ДНК доменом AML1/Runx-1 Runt и его аллостерическим контролем с помощью CBFbeta. Клетка. 2001; 104: 755–767. [PubMed] [Google Scholar] 26. Komori T, et al. Направленное разрушение Cbfa1 приводит к полному отсутствию костеобразования из-за задержки созревания остеобластов. Клетка. 1997;89:755–764. [PubMed] [Google Scholar] 27. Otto F, et al. Cbfa1, ген-кандидат для синдрома ключично-черепной дисплазии, необходим для дифференцировки остеобластов и развития костей. Клетка. 1997; 89: 765–771. [PubMed] [Google Scholar] 28. Levanon D, et al. Фактор транскрипции Runx3 регулирует развитие и выживание нейронов ганглиев задних корешков TrkC. EMBO J. 2002; 21: 3454–3463. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] 29. Okuda T, van Deursen J, Hiebert SW, Grosveld G, Downing JR. AML1, мишень множественных хромосомных транслокаций при лейкемии человека, необходим для нормального гематопоэза печени плода. Клетка. 1996;84:321–330. [PubMed] [Google Scholar] 30. Wang Q, et al. Нарушение гена Cbfa2 вызывает некроз и кровоизлияния в центральной нервной системе и блокирует дефинитивное кроветворение. Proc Natl Acad Sci USA. 1996;93:3444–3449. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] 31. Collins A, Littman DR, Taniuchi I. Белки RUNX в сетях факторов транскрипции, которые регулируют выбор линии T-клеток. Нат Рев Иммунол. 2009; 9: 106–115. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] 32. Вун Д., Хор Ю.Т., Ито Ю. Комплекс RUNX: переход от кроветворения к иммунитету. Фронтальная иммунология. 2015; 146: 523–36. [PubMed] [Google Scholar] 33. Bae SC, Ito Y. Механизмы регуляции гетеродимерного фактора транскрипции, PEBP2/CBF. Гистол Гистопатол. 1999; 14:1213–1221. [PubMed] [Google Scholar] 34. Fainaru O, et al. Runx3 регулирует TGF-бета-опосредованную функцию дендритных клеток мыши, и его отсутствие приводит к воспалению дыхательных путей. ЕМБО Дж. 2004; 23:969–979. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] 35. Chopin M, et al. Клетки Лангерганса генерируются двумя различными PU.1-зависимыми транскрипционными сетями. J Эксперт Мед. 2013; 210:2967–80. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] 36. Borkowski TA, Letterio JJ, Farr AG, Udey MC. Роль эндогенного трансформирующего фактора роста бета 1 в биологии клеток Лангерганса: кожа мышей с нулевым трансформирующим фактором роста бета 1 лишена эпидермальных клеток Лангерганса. J Эксперт Мед. 1996;184:2417–2422. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] 37. Bruno L, et al. Белки Runx регулируют экспрессию Foxp3. J Эксперт Мед. 2009; 206: 2329–2337. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] 38. Kitoh A, et al. Незаменимая роль транскрипционного комплекса Runx1-Cbfbeta для подавления in vivo функции регуляторных Т-клеток FoxP3+. Иммунитет. 2009; 31: 609–620. [PubMed] [Google Scholar] 39. Rudra D, et al. Комплексы Runx-CBFbeta контролируют экспрессию фактора транскрипции Foxp3 в регуляторных Т-клетках. Нат Иммунол. 2009 г.;10:1170–1177. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] 40. Йозефович С.З., Лу Л.Ф., Руденский А.Ю. Регуляторные Т-клетки: механизмы дифференцировки и функции. Анну Рев Иммунол. 2012; 30: 531–564. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] 41. Taniuchi I, et al. Дифференциальные потребности в белках Runx для репрессии CD4 и эпигенетического молчания во время развития Т-лимфоцитов. Клетка. 2002; 111: 621–633. [PubMed] [Google Scholar] 42. Telfer JC, Hedblom EE, Anderson MK, Laurent MN, Rothenberg EV. Локализация доменов факторов транскрипции Runx, необходимых для репрессии CD4 в тимоцитах. Дж Иммунол. 2004;172:4359–4370. [PubMed] [Google Scholar] 43. Berger MF, et al. Компактные универсальные ДНК-микрочипы для всестороннего определения специфичности сайтов связывания факторов транскрипции. Нат Биотех. 2006; 24:1429–1435. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] 44. Boucheron N, et al. Целостность линии Т-клеток CD4(+) контролируется деацетилазами гистонов HDAC1 и HDAC2. Нат Иммунол. 2014; 15:439–448. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] 45. Aken BL, et al. Ensembl 2017. Nucleic Acids Res. 2017;45:635–642. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] 46. Ян З. PAML 4: филогенетический анализ методом максимального правдоподобия. Мол Биол Эвол. 2007; 24:1586–1591. [PubMed] [Google Scholar] 47. Nah GS, Lim ZW, Tay BH, Osato M, Venkatesh B. Гены семейства Runx у хрящевых рыб слоновой акулы (Callorhinchus milii) PLoS One. 2014;9:e93816. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] 48. Takahashi S, et al. Трансгены фактора GATA под контролем локуса GATA-1 восстанавливают дефицит мутанта GATA-1 зародышевой линии.