28.01.2023 | Leave a comment Содержание перевод на русский, синонимы, антонимы, произношение, примеры предложений, транскрипция, определение,значение, словосочетанияwhen перевод и транскрипция, произношение, фразы и предложенияместоимениенаречиесоюзПредложения Соединение транскрипции и трансляции: прямые взаимодействия РНК-полимеразы с рибосомами и рибосомными субъединицами Принадлежности Авторы Принадлежности Абстрактный Цифры Похожие статьи Цитируется использованная литература термины MeSH вещества Грантовая поддержка Разница между транскрипцией и переводом Основное отличие — транскрипция и перевод Что такое транскрипция Что такое трансляция Разница между транскрипцией и трансляцией Цель Матрица Местоположение Ферменты Инициация Прекурсоры Удлинение Тип форм связи Прекращение Продукт Обработка продукта Ингибирование антибиотиками Заключение перевод на русский, синонимы, антонимы, произношение, примеры предложений, транскрипция, определение,значение, словосочетания And this would be the moment when the enthusiasm trickled, and it would maybe also get, like, awkwardly silent in the room, and I would think this was terribly sad, because I do believe our bowels are quite charming. И в этот момент у собеседника пропадал энтузиазм, иногда в комнате воцарялась неловкая пауза, а я думала, что всё это ужасно грустно, потому что я искренне верю, что наши кишечники весьма очаровательны. And they will then send this information up to our brain, and this is the moment when our brain knows, Oh, I have to go to the toilet. Они посылают эту информацию в мозг, и именно в этот момент мозг узнаёт: О — о, мне нужно в туалет. And I think this happens a lot of times when you look at the gut, actually. Я думаю, это происходит каждый раз, когда присматриваешься к кишечнику. And when I learned of the suicide the next day, I thought: Could the gut have something to do with it? Когда на следующий день я узнала о самоубийстве, то подумала: Может, кишечник имеет к этому какое — то отношение? We know this, for example, in stressful situations, when there are transmitters from the brain that are being sensed by our gut, so the gut will try to lower all the work, and not be working and taking away blood and energy to save energy for problem-solving. Мы знаем это, например, по стрессовым ситуациям, когда определённые мозговые нейромедиаторы передают команду кишечнику, из — за чего кишечник будет стараться приостановить всю работу, чтобы не забирать кровь и энергию и сохранить ресурсы для решения проблемы. So you see, there are more questions when it comes to cleanliness. Так что, когда дело касается порядка, очевидно, что тут ещё есть вопросы. So the pregnant mothers, when they go into labor, can call the emergency services and tell them exactly where to pick them up from, because otherwise, the ambulances have often taken hours to find them. Теперь беременные женщины по дороге на работу могут вызвать скорую, точно обозначив место, откуда их необходимо забрать, в противном случае скорой потребуется несколько часов, чтобы их найти. They are captured at the moment when they believe in being someone else entirely. Я снимаю их в тот момент, когда они верят полностью в то, что могут быть кем — то другим. For my work, I invite people to play a game like we all used to as children when we pretend to be someone else and that process made us really happy. В своей работе я предлагаю людям сыграть в игру, как раньше, когда мы были детьми, когда мы претворялись кем — то другим, и это делало нас по — настоящему счастливыми. And when I thought about the unspeakable horrors that my ancestors had been through in this country so that I could have it better, my shame grew even deeper. Когда я думала о невыносимых ужасах, которые пришлись на долю моих предков в этой стране ради лучшей жизни для потомков, мой стыд только увеличивался. And when we deny our humanity, it leaves us feeling empty inside, searching for ways to self-medicate in order to fill the void. И когда мы отрицаем свою человечность, она заставляет нас чувствовать себя опустошёнными и искать способы самолечения, чтобы заполнить пустоту. But it will all be OK when you have your support system to help you through it. Но всё наладится, когда у вас появится поддержка. A year later, in 1916, Einstein derived from his theory that gravitational waves existed, and that these waves were produced when masses move, like, for example, when two stars revolve around one another and create folds in space-time which carry energy from the system, and the stars move toward each other. Годом позже, в 1916 году, Эйнштейн на основе своей теории пришёл к выводу о существовании гравитационных волн. It started slowly, but as they emitted gravitational waves, they grew closer together, accelerating in speed, until, when they were revolving at almost the speed of light. Сначала медленно, но из — за излучения гравитационных волн они приближались друг к другу, ускоряясь до тех пор, пока не начали вертеться почти со скоростью света. When these gravitational waves passed by Earth, which was in 2015, they produced changes in all distances — the distances between all of you, the distances between you and me, our heights — every one of us stretched and shrank a tiny bit. Когда гравитационные волны прошли через Землю в 2015 году, изменения произошли на всех расстояниях — расстояниях между вами, расстояниях между вами и мной, в длине нашего роста — мы все немного растянулись и сократились. Since time immemorial, humanity — all of us, everyone, as kids — when we look up at the sky for the first time and see the stars, we wonder, What are stars? Человечество с незапамятных времён, включая всех нас, впервые посмотрев на небо и увидев звёзды, задаётся вопросом: Что такое звёзды? This is a revolution in astronomy, like when Galileo invented the telescope. Это революция в астрономии, так же, как когда Галилей изобрёл телескоп. However, something changed me a few years ago, when I came across a little secret that we have in Britain. Однако пару лет назад всё изменилось, когда я натолкнулась на маленький секрет британских учёных. So it all starts back in 1946, just a few months after the end of the war, when scientists wanted to know what it was like for a woman to have a baby at the time. Оно началось в 1946 — м, через несколько месяцев после окончания войны, тогда учёные хотели знать, каково было женщине в то время иметь ребёнка. The data showed that even when their parents were doing everything right — putting them to bed on time and reading to them every day and everything else — that only got those children so far. Данные показали, что даже если родители делали всё правильно — укладывали спать вовремя, читали каждый день, и всё остальное — это помогает лишь до определённого уровня. I realized I was so busy working, and ironically, learning and writing about this incredible study of British children, that there were days when I hardly even spoke to my own British children. Я поняла, что была так занята, работая, и вот ирония, изучая и описывая это невероятное исследование о британских детях, что бывали дни, когда я почти не общалась со своими британскими детьми. So at home, we introduced talking time, which is just 15 minutes at the end of the day when we talk and listen to the boys. Поэтому дома мы ввели «время для общения», это всего лишь 15 минут в конце дня, когда мы говорим и слушаем сыновей. When we were in the middle of the frozen river, we were filming about the condition of the cold weather and the environment that North Koreans had to deal with when they seek their freedom. Когда мы были на середине реки, мы снимали отрывок о холодной погоде и о тех условиях, в которых оказываются жители Северной Кореи, когда стремятся к свободе. Yes, and I clearly remember the feeling of fear and being threatened, and tension rising up between me and the interrogator when we talked about politics. Да, и я чётко помнила чувство страха и угрозы и напряжение между мной и следователем, когда мы говорили о политике. But we were able to see each other as human beings when we talked about family, everyday life, the importance of the future for our children. И тем не менее, мы видели друг в друге людей когда говорили о семье, жизненных буднях, важности будущего наших детей. When we get to the industrial revolution. Как раз во времена промышленной революции. So when giant clams start to disappear from coral reefs, their absence can serve as an alarm bell for scientists. Если тридакны начнут исчезать из коралловых рифов, их отсутствие станет тревожным сигналом для учёных. And when you start the game, you have an empty piece of land. В самом начале игры у вас есть пустой участок земли. When you think of a fish school, or when I think of a flock of starlings, that feels like a really different kind of intelligence. Когда вы думаете о стае рыб, или когда я думаю о стае скворцов, это похоже на совсем другой вид интеллекта. I believe that we can choose our rules, and we engineer not just robots but we can engineer our own human collective, and if we do and when we do, it will be beautiful. Я верю, что мы можем выбирать правила и создавать не только роботов, но и наш человеческий коллектив, и когда мы этого достигнем, это будет прекрасно. So I had a unique advantage when I started studying this desert. так что у меня была уникальная возможность изучить пустыню. When you look at all of this wonderful world, every species has its own learning program. Если взглянуть на этот прекрасный мир — каждое живое существо имеет свою программу обучения. What do you think when you see this? О чём вы думаете, когда видите это? I discovered this when I made this performance in 2013 on Heritage Day. Я обнаружила это, когда я провела этот перформанс в День наследия в 2013 — м. And then she said, Oh, What can you do when you know that? И потом она сказала: «О, а что можно сделать, зная это?» This is when the great minds of physics were grappling with the nature of determinism and what it means only to have a probability that a particle might be somewhere, and whether any of it was real. Именно тогда великие умы физики боролись с природой детерминизма и чтó значит иметь лишь вероятность того, что частица может быть где — то, и было ли это реально. When these laws work together, they bring about the beautiful, messy, complex world we live in. Когда эти законы работают вместе, они создают тот красивый, запутанный, сложный мир, в котором мы живём. When I wrote the book, I had the chapter on spin. В моей книге была глава, посвящённая моменту импульса. So when it comes to reasons for studying physics, for example, here is the best reason I can think of: I think that each of us has three life-support systems. Поэтому, когда речь идёт о том, зачем нам изучать физику, вот лучшая причина, которая приходит в голову: я думаю, что у каждого из нас три системы жизнеобеспечения. When someone mentions Cuba, what do you think about? Когда кто — то упоминает Кубу, о чём вы думаете? What about when somebody mentions North Korea? А если говорят о Северной Корее? When I hear stories like this, I think that what people picture is that trade happens between only two countries. Когда слышу такие истории, я думаю об ошибочном представлении, что торговые операции осуществляются лишь между двумя странами. When you go home tonight, take a look in your house. Вернувшись сегодня домой, осмотрите своё жильё. But when he gave the money to the vendor, the vendor drew back. Но когда он отдал их продавцу газет, тот отшатнулся. But when you lead with love, you create a bond that lifts each of you up. Но когда вы начинаете с любви, создаётся связь, которая поддерживает каждого из вас. But afterwards they felt less self-centered, and they even behaved more generously when given the chance to help someone. После этого они были менее зациклены на себе и даже вели себя более великодушно, если им выпадал шанс кому — то помочь. When I was younger, I was lucky enough to be surrounded by all of the pillars. Когда я была моложе, мне повезло, и я была окружена всеми этими элементами. Their practice also involved serving all of creation through small acts of love, which meant being kind even when people wronged you. Их практика также включала в себя служение всему мирозданию с помощью небольших проявлений любви, что означало проявлять доброту, даже если люди плохо с тобой поступили. He survived, and when I asked him what was going through his mind as he faced death, he said all he could think about was needing to live so he could be there for my brother and me, and this gave him the will to fight for life. Он выжил, и когда я спросила его, что промелькнуло в его голове, когда он встретился со смертью, он сказал, что мог думать только о том, что нужно жить, чтобы он мог быть рядом со мной и моим братом, и это дало ему сил бороться за жизнь. When he went under anesthesia for emergency surgery, instead of counting backwards from 10, he repeated our names like a mantra. Когда он был под анестезией перед срочной операцией, вместо того, чтобы считать от десяти до нуля, он повторял наши имена, как мантру. But when life is really good and when things are really bad, having meaning gives you something to hold on to. Но когда жизнь действительно хороша, и когда всё действительно плохо, смысл жизни даёт вам что — то, за что можно ухватиться. When we engage in dialogue, we flip the script. Когда мы начинаем диалог, мы нарушаем сценарий. Clouds that, when we see them, pollute our dreams. Облака, вид которых загрязняет наши мечты. And when you join them, bend them and fold them, it creates a space full of air. И когда они соединяются и сворачиваются, создаётся пространство, полное воздуха. When the sun comes up from the horizon, the museum rises up to the sky. Когда солнце выходит из — за горизонта, музей поднимается в небо. I remember when I was at NASA in 2009 with 120 engineers. Помню, как в 2009 году я побывал в НАСА в числе 120 других инженеров. You guys know, too, when you go up in a plane, the control panels are gigantic. Вам известно, как взлетают самолёты: при помощи огромных, невероятно сложных в устройстве приборных панелей. It has sensors that, when it moves, make sort of drawings in the air. Есть несколько сенсоров, которые, когда двигаются, оставляют в воздухе рисунки. When two or more people get too close together, even those farthest away are affected — everyone falls to the same spot. И если двое и больше людей слишком приблизятся друг к другу, это подействует на людей вдалеке от них: все они упадут в одно и тоже место. There are moments when we have to face the void, and fear can paralyze us. Бывает, что мы оказываемся над пустотой и парализованы страхом.when перевод и транскрипция, произношение, фразы и предложения [wen]местоимение которыйСинонимы: wherein, whose, which, who, whereby.наречие когда (как только) несмотря наСинонимы: nonetheless, nevertheless, however.союз если хотя в то время какСинонимы: while, albeit, whilst, whereas, notwithstanding, yet, supposing, however, howbeit, unless, provided, whenever, if, sobeit, whom, although.ПредложенияWhen she was young, she was very popular.В молодости она была очень популярна.When did you start writing songs?Когда вы начали писать песни?Don’t be afraid of making mistakes when speaking English.Не бойтесь делать ошибки, когда говорите по-английски.When you’re young and you’re in love, the world seems beautiful.Когда ты юн и влюблён, мир кажется прекрасным.When he comes back, tell him I’m indisposed and shall get back at him tomorrow.Когда он вернётся, скажите ему, что я не в лучшем расположении духа и завтра воздам ему сторицей.What happens when we run out of water?Что будет, когда у нас закончится вода?When the bell rang, the audience took their seats.Когда прозвенел звонок, зрители заняли свои места.When was the last time you upset your father?Когда в последний раз вы расстроили своего отца?When did they leave?Когда они уехали?When did you say that?Когда вы это говорили?When the last tree is cut down, when the last river is poisoned, when the last bird is caught, — only then will you realize that money can not be eaten. Когда будет срублено последнее дерево, когда будет отравлена последняя река, когда будет поймана последняя птица, — только тогда вы поймете, что деньги нельзя есть.When do you have to file your income tax returns?Когда вы должны подать налоговую декларацию?She had been planting roses for two hours when he came.Она сажала розы уже два часа, когда он пришёл.I could not help laughing when I saw him.Я не мог удержаться от смеха, когда увидел его.Tom started playing the piano when he was thirteen years old.Том начал играть на пианино, когда ему было тринадцать.You shouldn’t be afraid of making mistakes when learning a language.Тебе не надо бояться делать ошибки, когда учишь язык.We acquired the property when our uncle died.Мы получили это имущество после смерти дяди.When Mary finds out about it she’ll throw a fit.Мэри закатит истерику, когда узнает об этом.Where were you when all this happened?Где вы были, когда всё это произошло?When can I see you next time?Когда мы увидимся в следующий раз?I wasn’t married when we first met.Я не был женат, когда мы впервые встретились.Never tell the truth when a good lie will do.Никогда не говорите правды, когда можно обойтись хорошей ложью.I hear my father was as old as I am now when he came up to Tokyo.Я слыхал, что отцу было столько же лет, сколько сейчас мне, когда он приехал в Токио.When did I say that?Когда я это сказал?When was the last time you saw Tom at school?Когда ты последний раз видел Тома в школе?We had been talking about Jim when he entered the room.Мы говорили о Джиме, когда он вошёл в комнату.Tom chuckled when he heard Mary’s joke.Том тихонько хихикнул, когда услышал шутку Маши.When did you come to Paris?Когда ты приехал в Париж? Соединение транскрипции и трансляции: прямые взаимодействия РНК-полимеразы с рибосомами и рибосомными субъединицами . 2017 2 ноября; 45 (19): 11043-11055. дои: 10.1093/нар/gkx719. Гаитянский веер 1 , Адам Б Конн 1 , Престон Б. Уильямс 2 , Стивен Диггс 1 , Джозеф Хам 1 , Говард Б. Гампер-младший 3 , Я-Мин Хоу 3 , Шон Э. О’Лири 1 , Иньшэн Ван 2 , Грегор М Блаха 1 Принадлежности 1 Кафедра биохимии, Калифорнийский университет, Риверсайд, Калифорния 92521, США. 2 Химический факультет Калифорнийского университета, Риверсайд, Калифорния 92521, США. 3 Кафедра биохимии и молекулярной биологии, Университет Томаса Джефферсона, Филадельфия, Пенсильвания 19107, США. PMID: 28977553 PMCID: PMC5737488 DOI: 10.1093/нар/gkx719 Бесплатная статья ЧВК Haitian Fan и др. Нуклеиновые Кислоты Res. 2017 . Бесплатная статья ЧВК . 2017 2 ноября; 45 (19): 11043-11055. дои: 10.1093/нар/gkx719. Авторы Гаитянский веер 1 , Адам Б Конн 1 , Престон Б. Уильямс 2 , Стивен Диггс 1 , Джозеф Хам 1 , Говард Б. Гампер-младший 3 , Я-Мин Хоу 3 , Шон Э. О’Лири 1 , Иньшэн Ван 2 , Грегор М Блаха 1 Принадлежности 1 Факультет биохимии Калифорнийского университета, Риверсайд, Калифорния 92521, США. 2 Химический факультет Калифорнийского университета, Риверсайд, Калифорния 92521, США. 3 Кафедра биохимии и молекулярной биологии, Университет Томаса Джефферсона, Филадельфия, Пенсильвания 19107, США. PMID: 28977553 PMCID: PMC5737488 DOI: 10.1093/нар/gkx719 Абстрактный У прокариот РНК-полимераза и рибосомы могут одновременно связываться с одним и тем же РНК-транскриптом, что приводит к функциональному сочетанию транскрипции и трансляции. Взаимодействия между РНК-полимеразой и рибосомами имеют решающее значение для координации транскрипции с трансляцией. Здесь мы сообщаем, что РНК-полимераза напрямую связывается с рибосомами и изолированными большими и малыми рибосомными субъединицами. РНК-полимераза и рибосомы образуют комплекс один к одному с микромолярной константой диссоциации. Образование комплекса модулируется конформационным и функциональным состоянием РНК-полимеразы и рибосомы. Поверхность связывания на большой рибосомной субъединице скрыта малой субъединицей во время синтеза белка, тогда как поверхность малой субъединицы остается доступной для растворителя. Сайт связывания РНК-полимеразы на рибосоме включает участок изолированной малой субъединицы рибосомы. Это прямое взаимодействие между РНК-полимеразой и рибосомами может способствовать соединению транскрипции с трансляцией. © Автор(ы), 2017. Опубликовано Oxford University Press от имени Nucleic Acids Research. Цифры Рисунок 1. Выделение комплексов РНК-полимераза•рибосома с использованием… Рисунок 1. Выделение комплексов РНК-полимераза•рибосома различными методами: ( A ) Центрифугирование в градиенте сахарозы.… Фигура 1. Выделение комплексов РНК-полимераза•рибосома с использованием различных методов: ( A ) Центрифугирование в градиенте сахарозы. На верхней панели показаны профили седиментации только РНК-полимеразы (штриховая синяя линия) и стехиометрической смеси РНК-полимеразы и рибосом (сплошная красная линия), зарегистрированные при 280 нм. Две нижние панели отображают результат электрофореза в SDS-полиакриламидном геле (SDS-PAGE) для каждой из фракций градиента сахарозы. На верхней панели показана область β/β’ SDS-PAGE, полученная в результате градиентного центрифугирования только РНК-полимеразы (РНКП), а на нижней панели представлен полный гель смеси РНК-полимеразы и рибосом (РНКП + 70S, маркерная дорожка). удалено для ясности). ( B ) Центрифугирование в градиенте глицерина. Панели такие же, как в A. Во время ультрацентрифугирования комплекс РНК-полимеразы и рибосомы постоянно уравновешивается, в результате чего связанная РНК-полимераза следует за рибосомой в A и B. ( C ) Эксклюзионная хроматография. На верхней панели показаны профили элюирования смеси РНК-полимеразы и рибосом (сплошная красная линия) и только РНК-полимеразы (штриховая синяя линия; для сравнения поглощение увеличивается в 160 раз) из колонки 10/30 Superdex 200. . (D и E) Захват комплексов His-меченой РНК-полимеразы • рибосомы на спин-колонке с Ni-сефарозой. ( D ) Результаты SDS-PAGE для всех фракций, т.е. проточный (FT), промывки 0, 10 и 40 мМ имидазолом и элюирование 300 мМ имидазолом. ( E ) Результаты SDS-PAGE первой стадии элюирования 300 мМ имидазола из экспериментов по аффинному связыванию Ni 2+ . Различные количества РНК-полимеразы и рибосом загружаются либо вместе, либо последовательно — сначала РНК-полимераза («1-я загрузка»), за которой следует стехиометрическое количество рибосом («2-я загрузка»). Эти эксперименты проводят в присутствии 30 мМ KCl и 250 мМ KCl. ( F ) РНК-полимераза, связывающаяся с рибосомами в присутствии 10 мМ фосфатного буфера (PO 4 ), 20 мкМ бычьего сывороточного альбумина (БСА), 14-нуклеотидной длинной РНК (РНК) в концентрации 5 мкМ или 80 мкг поли(U)-РНК. Рисунок 2. Титрование РНК-полимеразы с… Рисунок 2. Титрование РНК-полимеразы рибосомами и наоборот . ( А )… Фигура 2. Титрование РНК-полимеразы рибосомами и наоборот . ( A ) Связывание рибосом с РНК-полимеразой. РНК-полимеразу (1 мкМ) инкубируют с возрастающими концентрациями рибосом в присутствии 55 мМ KCl (синие квадраты) или 250 мМ KCl (красные кружки). На врезке показана предложенная связывающая модель комплексообразования. ( B ) Связывание РНК-полимеразы с рибосомами. Рибосомы (1 мкМ) инкубируют с возрастающими концентрациями основного фермента РНК-полимеразы (синие квадраты) или холофермента (зеленые треугольники) в присутствии 55 мМ KCl или 250 мМ KCl (красные кружки, только основной фермент). Линии, соединяющие данные в A и B, представляют собой кривые связывания, рассчитанные, как описано в разделе «Материалы и методы» текста. Для холофермента показана смоделированная кривая связывания в присутствии равновесия димер-мономер. ( C ) Влияние функционального состояния РНК-полимеразы и рибосомы на образование комплекса РНК-полимераза-рибосома. Комплексообразование рибосом (70S), малых субъединиц (30S), больших субъединиц (50S) и рибосом, связанных с тРНК (70S•тРНК 2 •мРНК) с коровым ферментом РНК-полимеразой (кор), комплексом элонгации транскрипции (TEC) , холофермент (холо), ядерный фермент и комплекс удлинения транскрипции в присутствии NusG (NusG + ядро и NusG + TEC) анализировали центрифугированием в градиенте сахарозы. Рисунок 3. EDC сшивание РНК-полимеразы с рибосомой… Рисунок 3. EDC сшивание комплексов РНК-полимераза-рибосома. ( A ) Сшивание РНК EDC… Рисунок 3. EDC сшивание комплексов РНК-полимераза-рибосома. ( A ) Сшивание EDC РНК-полимеразы в присутствии малой субъединицы рибосомы (30S), большой субъединицы рибосомы (50S) и рибосомы (70S) с 30 мМ и 250 мМ KCl. ( B ) Нормализованный взвешенный спектральный индекс анализа LC-MS/MS перекрестной связи РНК-полимераза-рибосома, очищенная трис-глицином SDS-PAGE. ( C ) Диаграмма Венна сшитых белков после воздействия EDC на смесь РНК-полимеразы и рибосом и выделение уникальных сшитых видов с помощью 6–10% трис-глицина (одна полоса) и 6–9% Трис-ацетат SDS-PAGE (две полосы). ( D и E ) Диаграмма Венна белков двух видов, выделенных из 6–9% трис-ацетата в ПААГ, которые специфичны для перекрестного связывания EDC РНК-полимеразы в присутствии малой и большой рибосомных субъединиц. . Рисунок 4. Модели для связывания РНК-полимеразы… Рис. 4. Модели связывания РНК-полимеразы с малой субъединицей рибосомы, большой рибосомной… Рисунок 4. Модели связывания РНК-полимеразы с малой субъединицей рибосомы, большой субъединицей рибосомы и рибосомой. Рибосомальные белки, сшитые с РНК-полимеразой (РНКП, зеленым цветом), обозначены оранжевым цветом для малой рибосомной субъединицы (30S, желтым), темно-синим цветом для большой рибосомной субъединицы (50S, голубым цветом) и красным цветом для всей рибосомы. (70С). Модель полноразмерной РНК-полимеразы основана на крио-ЭМ-структуре 9РНК-полимераза 0179 E. coli (PDB: 5UPC (89)) и ЯМР-структура С-концевого домена α-субъединицы (PDB: 2MAX (90)). Модели рибосомы и ее субъединиц основаны на крио-ЭМ структуре рибосом E. coli (PDB: 4V6Q (91)). Чтобы завершить модель рибосомы, ножка L1 моделируется на основе кристаллической структуры ножки L1 (PDB: 1U63 (92)), ножка L7/L12 основана на ЯМР-структуре L10•(L7/L12) 4 (PDB 1RQU (93)), С-концевые остатки рибосомного белка S6 моделируются по полноразмерному S6 в крио-ЭМ структуре рибосомы (PDB: 4V6P (93)).1)), а рибосомный белок S1 моделируется на основе кристаллической структуры домена I в комплексе с рибосомным белком S2 (PDB 4TOI (94)) и ЯМР-структур доменов 4 и 6 (PDB 2KHI и 2KHJ (95)). Взаимное положение РНК-полимеразы на малой субъединице рибосомы и рибосоме сдерживается выявленными поперечными связями, а также предположением, что зарождающаяся РНК между РНК-полимеразой и рибосомой имеет наименьшую длину при транскрипционно-трансляционном сопряжении. Заштрихованные области, окружающие различные компоненты рибосомы в A-D, указывают на пространственную гибкость. На малой субъединице рибосомы гибкий участок включает рибосомный белок S1; на большой рибосомной субъединице он включает ножку L1, ножку L7 и рибосомный белок L9; а на рибосоме ножка L1, ножка L7 и рибосомные белки S1 и L9. ( A ) Малая субъединица рибосомы, вид с цитозольного участка со сшитыми рибосомными белками S6, S2, S11, S7, S9 и S1 оранжевого цвета. Зеленой границей обозначено положение РНК-полимеразы на малой субъединице рибосомы. ( B ) Большая субъединица, вид со стороны интерфейса рибосомной субъединицы. Темно-синим цветом показаны сшитые белки L1, L9 и L19, а синим цветом – L2, известный партнер по связыванию α-субъединицы РНК-полимеразы. ( C ) Рибосома с идентифицированными сшитыми белками S6, S9 и L7, выделенными красным цветом. ( D ) Модель взаимодействия РНК-полимеразы с рибосомой, основанная на химических поперечных связях, выявленных в этом исследовании. Фигуры были подготовлены в PyMOL (Schrödinger, LLC) с радиусом растворителя 5 Å. См. это изображение и информацию об авторских правах в PMC Похожие статьи Две старые собаки, один новый трюк: обзор взаимодействий РНК-полимеразы и рибосом во время сопряжения транскрипции и трансляции. Конн А.Б., Диггс С., Тэм Т.К., Блаха Г.М. Конн А.Б. и др. Int J Mol Sci. 2019 27 мая; 20 (10): 2595. дои: 10.3390/ijms20102595. Int J Mol Sci. 2019. PMID: 31137816 Бесплатная статья ЧВК. Обзор. Функциональное картирование механизма трансляции E. coli с использованием отслеживания отдельных молекул. Мохапатра С., Вайсшаар Дж.К. Мохапатра С. и др. Мол микробиол. 2018 Октябрь; 110 (2): 262-282. doi: 10.1111/mmi.14103. Epub 2018 1 октября. Мол микробиол. 2018. PMID: 30107639 Рибосомный белок L31 в Escherichia coli способствует ассоциации и трансляции рибосомных субъединиц, тогда как короткий L31, расщепленный протеазой 7, снижает обе активности. Уэта М., Вада С., Бесшо Ю., Маэда М., Вада А. Уэта М. и соавт. Клетки генов. 2017 май; 22(5):452-471. doi: 10.1111/gtc.12488. Epub 2017 10 апр. Клетки генов. 2017. PMID: 28397381 Контроль взаимодействий ортогональных субъединиц рибосом позволяет развить новую функцию. Schmied WH, Tnimov Z, Uttamapinant C, Rae CD, Fried SD, Chin JW. Шмид В.Х. и соавт. Природа. 2018 декабрь; 564 (7736): 444-448. doi: 10.1038/s41586-018-0773-z. Epub 2018 5 декабря. Природа. 2018. PMID: 30518861 Бесплатная статья ЧВК. Фактор инициации 2 стабилизирует рибосому в полуповернутой конформации. Линг С., Ермоленко Д.Н. Линг С. и др. Proc Natl Acad Sci U S A. 2015 Dec 29;112(52):15874-9. doi: 10.1073/pnas.1520337112. Epub 2015 14 декабря. Proc Natl Acad Sci U S A. 2015. PMID: 26668356 Бесплатная статья ЧВК. Посмотреть все похожие статьи Цитируется Систематический анализ лежащей в основе геномной архитектуры транскрипционно-трансляционной связи у прокариот. Бхарти Р., Зиберт Д., Бломбах Б., Гримм Д.Г. Бхарти Р. и др. НАР Геном Биоинформ. 2022, 27 сентября; 4(3):lqac074. doi: 10.1093/nargab/lqac074. электронная коллекция 2022 сент. НАР Геном Биоинформ. 2022. PMID: 36186922 Бесплатная статья ЧВК. Структурные достижения в элонгации транскрипции. Мохамед А.А., Васкес Нуньес Р., Вос С.М. Мохамед А.А. и соавт. Curr Opin Struct Biol. 2022 авг;75:102422. doi: 10.1016/j.sbi.2022.102422. Epub 2022 9 июля. Curr Opin Struct Biol. 2022. PMID: 35816930 Бесплатная статья ЧВК. Обзор. Регуляция экспрессии генов посредством эффектор-зависимого конформационного переключения с помощью кобаламиновых рибопереключателей. Леннон С.Р., Бати РТ. Леннон С.Р. и др. Дж Мол Биол. 2022 30 сентября;434(18):167585. doi: 10.1016/j.jmb.2022.167585. Epub 2022 12 апр. Дж Мол Биол. 2022. PMID: 35427633 Обзор. Анализ 3′-конца мРНК in vitro с использованием бесклеточной экспрессионной системы E. coli . N MPA, Lim HM. Н МПА и др. Био проток. 2022 20 февраля; 12 (4): e4333. doi: 10.21769/BioProtoc.4333. Электронная коллекция 2022 20 февраля. Био проток. 2022. PMID: 35340297 sRNA-опосредованная регуляция мРНК gal в E. coli: участие в расщеплении транскрипта РНКазой E вместе с Rho-зависимой терминацией транскрипции. Чон Х.Дж., Ли И., N MPA, Ван Х., Чатторадж Д.К., Лим Х.М. Чон Х.Дж. и др. Генетика PLoS. 2021 28 октября; 17 (10): e1009878. doi: 10.1371/journal.pgen.1009878. электронная коллекция 2021 окт. Генетика PLoS. 2021. PMID: 34710092 Бесплатная статья ЧВК. Просмотреть все статьи «Цитируется по» использованная литература Бакши С. , Чой Х., Вайсшаар Дж. К. Пространственная биология транскрипции и трансляции в быстрорастущих кишечных палочках. Фронт. микробиол. 2015 г.; 6:636. — ЧВК — пабмед Zhang Y., Mooney R., Grass J., Sivaramakrishnan P., Herman C., Landick R., Wang J. DksA защищает удлиняющуюся РНК-полимеразу от остановки, вызванной остановкой рибосомы. Мол. Клетка. 2014; 53:766–778. — ЧВК — пабмед Датта Д. , Шаталин К., Эпштейн В., Готтесман М.Е., Нудлер Э.. Связывание обратного отслеживания РНК-полимеразы с нестабильностью генома у E. coli. Клетка. 2011 г.; 146: 533–543. — ЧВК — пабмед Миркин Е.В., Миркин С.М.. Срыв репликационной вилки на естественных препятствиях. микробиол. Мол. биол. Рев.: ММБР. 2007 г.; 71:13–35. — ЧВК — пабмед Янофски С. , Ито Дж. Бессмысленные кодоны и полярность в триптофановом опероне. Дж. Мол. биол. 1966 год; 21:313–334. — пабмед термины MeSH вещества Грантовая поддержка R01 GM114343/GM/NIGMS NIH HHS/США U01 GM108972/GM/NIGMS NIH HHS/США Разница между транскрипцией и переводом Основное отличие — транскрипция и перевод Транскрипция и трансляция участвуют в процессе экспрессии генов, необходимых для функционирования клетки. Транскрипция — это копирование генов в геноме в фрагменты РНК. Трансляция – это расшифровка мРНК в белки. Транскрипция ДНК в РНК и трансляция РНК в белки считаются центральной догмой молекулярной биологии. Основное различие между транскрипцией и трансляцией заключается в том, что транскрипция включает в себя производство РНК из ДНК, тогда как трансляция включает в себя синтез белка путем декодирования мРНК. В этой статье рассматривается, 1. Что такое транскрипция — Определение, процесс, характеристики 2. Что такое перевод — определение, процесс, характеристики 9018 3. разница между ядрышком и ядром Что такое транскрипция Транскрипция является первым этапом процесса экспрессии гена . Ген копируется в фрагмент РНК с помощью фермента РНК-полимеразы. Этот фрагмент РНК называется первичным транскриптом. Она комплементарна и антипараллельна последовательности ДНК, с которой скопирована. Транскрипция может продуцировать несколько типов РНК: информационная РНК (мРНК), транспортная РНК (тРНК), рибосомная РНК (рРНК) и некодирующая РНК, такая как микроРНК (миРНК). Гены, кодируемые для белков, производят мРНК. мРНК состоят из нетранслируемых областей, называемых 5’UTR и 3’UTR, для регуляции синтеза белка. Считается, что другие типы РНК помогают синтезу, регуляции и обработке белков. У вирусов мРНК синтезируется из геномной РНК. Их геном состоит из одноцепочечной РНК с отрицательным смыслом. Во время репликации РНК образуется одноцепочечная РНК с положительным смыслом, которая позднее может быть использована в трансляции. Некоторые вирусы, такие как ВИЧ, транскрибируют геномы РНК в ДНК с помощью фермента обратной транскриптазы. Таким образом, синтез комплементарной ДНК из РНК называют обратной транскрипцией. При прокариотической и эукариотической транскрипции антисмысловая цепь транскрибируется в мРНК в направлении от 5′ к 3′. Это исключает образование фрагментов Окадзаки, как при репликации ДНК. Кроме того, РНК-полимераза не нуждается в РНК-праймерах для инициации транскрипции. Процесс транскрипции происходит в четыре стадии: инициация, бегство от промотора, элонгация и терминация. Транскрипция инициируется связыванием РНК-полимеразы с промотором с помощью ассоциированных белков, называемых транскрипционными факторами. У эукариот можно идентифицировать шесть факторов транскрипции, связанных с РНК-полимеразой II: TFIIA, TFIIB, TFIID, TFIIE, TFIIF и TFIIH. Инициация транскрипции регулируется активаторами и репрессорами. После образования комплекса инициации транскрипции добавляются несколько нуклеотидов, и РНК-полимераза ускользает от промотора. Затем формируется комплекс элонгации транскрипции. РНК-полимераза пересекает антисмысловую цепь ДНК и добавляет нуклеотиды, комплементарные матрице, чтобы получить новую цепь РНК. В качестве предшественников нуклеотидов используются аденин, урацил, цитозин и гуанин. Первичный транскрипт отщепляется от матрицы при прекращении процесса. У эукариот расщепление сопровождается посттранскрипционными модификациями, такими как полиаденилирование, кэпирование 5′-конца и сплайсинг интронов. Простая диаграмма, иллюстрирующая транскрипцию и процессинг, показана на 9.0325 рисунок 1 . Рисунок 1: Транскрипция и процессинг РНК Антибиотики действуют как ингибиторы транскрипции. Поэтому их можно использовать для лечения бактериальных и грибковых инфекций у человека. Рифампицин и 8-гидроксихинолин представляют собой два антибиотика, которые ингибируют транскрипцию у бактерий и грибов соответственно. С другой стороны, транскрипцию можно измерить с помощью RT-PCR, ДНК-микрочипов, гибридизации in situ, нозерн-блоттинга и РНК-секвенирования, подобных молекулярно-биологическим методам. Что такое трансляция Трансляция — это второй этап в процессе экспрессии генов. мРНК, полученные путем транскрипции, транслируются в белки в цитоплазме с помощью рибосом. Во время трансляции мРНК расшифровывается рибосомами с образованием цепочки аминокислот или полипептидной цепи. Комплементарные последовательности антикодонов тРНК, несущие определенную аминокислоту, связываются с мРНК. Этот тип тРНК называется аминоацил-тРНК. Связывание облегчается рибосомами. Аминокислоты переносятся тРНК из полипептидной цепи путем образования пептидной связи между двумя аминокислотами. Эта аминокислотная цепь подвергается посттрансляционным модификациям, а затем сворачивается в трехмерную структуру, чтобы стать активным белком. Трансляция происходит в три этапа: инициация, удлинение и терминация. Чтобы инициировать трансляцию, рибосомы собираются вокруг мРНК-мишени. Первой добавленной тРНК является метионин, несущий тРНК, который соответствует стартовому кодону AUG на 5′-конце мРНК. Кодон представляет собой последовательность из трех нуклеотидов на мРНК, которая кодирует определенную аминокислоту. После присоединения первой тРНК к стартовому кодону к мРНК присоединяется тРНК, соответствующая второму кодону. Затем рибосома транслоцируется ко второй тРНК. Первая и вторая аминокислоты, переносимые тРНК, образуют между собой пептидную связь. Точно так же декодирование происходит по мере того, как рибосомы перемещаются в направлении от 5′ к 3′ на мРНК. Аминокислота присоединяется к С-концу полипептидной цепи. Следовательно, трансляция считается направленной на аминокарбоксильную группу. Когда рибосома достигает стоп-кодона (UAG, UAA, UGA), она высвобождает полипептидную цепь. Простая схема перевода показана на Рисунок 2. Рисунок 2: Трансляция рибосомной мРНК Прокариоты содержат небольшие рибосомы, называемые 70S рибосомами, тогда как эукариотические рибосомы сравнительно большие и называются 80S рибосомами. Рибосома состоит из двух субъединиц, которые называются большой субъединицей и малой субъединицей. У эукариот небольшая субъединица 80S рибосомы связывается с 5′-концом мРНК. Но у прокариот малая субъединица 70S рибосомы связывается с последовательностями Шайна-Дальгарно в мРНК. Последовательность Шайна-Дальгарно отмечает начало каждой кодирующей последовательности прокариотического оперона. Многие антибиотики, способные ингибировать трансляцию, включают хлорамфеникол, тетрациклин, анизомицин, циклогексимид, стрептомицин и т. д. Трансляцию можно измерить с помощью методов спектрометрии, биохимических анализов и методов на основе антител, таких как ELISA и вестерн-блоттинг. Разница между транскрипцией и трансляцией Цель Транскрипция: Основной целью является синтез РНК-копий генетических инструкций, записанных в геноме. Перевод: Основной целью является синтез белков из РНК, которые копируются с генов. Матрица Транскрипция: Матрица — это гены в геноме. Перевод: Матрица представляет собой мРНК. Местоположение Транскрипция: Это происходит в ядре. Перевод: Это происходит в цитоплазме. Ферменты Транскрипция: РНК-полимераза представляет собой фермент. Перевод: Рибосомы — это ферменты. Инициация Транскрипция: Связывание РНК-полимеразы с промотором гена инициирует образование комплекса инициации транскрипции. РНК-полимераза направляется промотором к сайту инициации транскрипции. Трансляция: Связывание метионина, несущего тРНК, со стартовым кодоном AUG инициирует трансляцию. Прекурсоры Транскрипция: Четыре азотистых основания: аденин, гуанин, цитозин и урацил являются предшественниками. Перевод: 20 различных аминокислот, переносимых тРНК, являются предшественниками. Удлинение Транскрипция: РНК-полимераза удлиняется от 5′ к 3′ направлению. Перевод: Входящая аминоацил-тРНК связывается с кодоном в А-сайте. Новая аминокислота связывается с растущей цепью. Рибосома перемещается в следующую позицию кодона с 5′ на 3′ направление. Тип форм связи Транскрипция: Можно наблюдать фосфодиэфирную связь между двумя нуклеотидами. Перевод: Можно наблюдать пептидную связь между двумя аминокислотами. Прекращение Транскрипция: Транскрипт высвобождается, фермент отсоединяется и ДНК перематывается. Перевод: Рибосома разбирается, встречаясь с одним из трех стоп-кодонов, и полипептидная цепь отсоединяется. Продукт Транскрипция: При транскрипции образуется несколько функциональных форм РНК: мРНК, тРНК, рРНК и некодирующая РНК. Перевод: Белки являются продуктами. Обработка продукта Транскрипция: Происходят посттранскрипционные модификации, такие как добавление 5′-кэпа, 3′-поли-А-хвоста и сплайсинга интронов. Перевод: Происходят многочисленные посттрансляционные модификации, такие как образование дисульфидных мостиков, фосфорилирование, фарнезилирование и т. д. Ингибирование антибиотиками Транскрипция: Они ингибируются рифампицином и 8-гидроксихинолином. Транскрипция: Они ингибируются тетрациклином, хлорамфениколом, стрептомицином, эритромицином, анизомицином, циклогексамидом и др. Перевод: Они локализованы в цитоплазме прокариот и рибосомах эукариот на эндоплазматическом ретикулуме. Заключение Транскрипция и трансляция вместе называются экспрессией генов. Во время транскрипции нуклеотиды используются для производства новой цепи РНК с помощью РНК-полимеразы и других связанных белков. С другой стороны, аминокислоты используются для производства полипептидной цепи в процессе трансляции. У эукариот и транскрипция, и трансляция добавляют модификации к своим конечным продуктам, которые называются посттранскрипционными и посттрансляционными модификациями соответственно. Посттранскрипционные модификации включают добавление 5′-кэпа, 3′-поли-А-хвоста и сплайсинг интронов.